93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2353 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2353  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  758    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2181  hypothetical protein  52.04 
 
 		 393 aa  363  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4004  hypothetical protein  50.25 
 
 		 403 aa  356  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2473  protein of unknown function DUF1501  48.18 
 
 		 394 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2183  protein of unknown function DUF1501  49.09 
 
 		 394 aa  328  9e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0901909  normal  0.892083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1794  hypothetical protein  43.92 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5238  hypothetical protein  40.27 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2340  hypothetical protein  40.1 
 
 		 405 aa  223  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40083  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4086  hypothetical protein  38.05 
 
 		 388 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2392  hypothetical protein  36.06 
 
 		 387 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.740599  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2539  protein of unknown function DUF1501  41.89 
 
 		 409 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3893  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.231247  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4475  hypothetical protein  40.37 
 
 		 385 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1385  hypothetical protein  40.55 
 
 		 385 aa  209  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18972  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5828  hypothetical protein  40.64 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00482968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4977  twin-arginine translocation pathway signal  32.69 
 
 		 408 aa  203  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3912  hypothetical protein  41.37 
 
 		 387 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4376  hypothetical protein  41.37 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1625  hypothetical protein  39.84 
 
 		 382 aa  200  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0177694  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3443  protein of unknown function DUF1501  38.04 
 
 		 386 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0821691  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5025  protein of unknown function DUF1501  38.5 
 
 		 382 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137288  normal  0.0850645 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4697  protein of unknown function DUF1501  35.26 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2868  hypothetical protein  35.32 
 
 		 413 aa  187  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2852  hypothetical protein  34.77 
 
 		 382 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4217  hypothetical protein  41.03 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.309158  normal  0.161239 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02839  hypothetical protein  34.58 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4116  protein of unknown function DUF1501  33.33 
 
 		 401 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5538  hypothetical protein  33.25 
 
 		 395 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0889473  normal  0.0405308 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4837  hypothetical protein  29.95 
 
 		 430 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3059  hypothetical protein  31.33 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2281  hypothetical protein  31.19 
 
 		 432 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.118635  hitchhiker  0.0000220293 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0377  protein of unknown function DUF1501  30.07 
 
 		 422 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5180  hypothetical protein  32.61 
 
 		 395 aa  133  5e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134419  normal  0.0704393 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4878  hypothetical protein  29 
 
 		 445 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0245766  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3315  protein of unknown function DUF1501  30.52 
 
 		 403 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6011  hypothetical protein  31.65 
 
 		 404 aa  129  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1681  hypothetical protein  31.65 
 
 		 400 aa  123  7e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2722  hypothetical protein  33.88 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1651  hypothetical protein  30.29 
 
 		 394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.500036 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1895  protein of unknown function DUF1501  30.03 
 
 		 394 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.213344  normal  0.16671 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3484  hypothetical protein  29.08 
 
 		 439 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2158  hypothetical protein  29.37 
 
 		 439 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1566  protein of unknown function DUF1501  29.77 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0377482  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3876  protein of unknown function DUF1501  31.4 
 
 		 425 aa  108  1e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0704  protein of unknown function DUF1501  28.05 
 
 		 422 aa  106  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0967  hypothetical protein  32.66 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.51998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0199  protein of unknown function DUF1501  27.45 
 
 		 404 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1189  protein of unknown function DUF1501  28.74 
 
 		 513 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.605021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2097  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.08 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4236  protein of unknown function DUF1501  27.4 
 
 		 411 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00624743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2503  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.73 
 
 		 418 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195458  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2348  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.73 
 
 		 413 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2390  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.73 
 
 		 418 aa  99.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3329  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.11 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0404389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1249  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.11 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.66735  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1483  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.11 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0185486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1882  protein of unknown function DUF1501  28.74 
 
 		 414 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1976  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.11 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.611081  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0518  hypothetical protein  26.61 
 
 		 388 aa  96.7  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2304  hypothetical protein  28.86 
 
 		 401 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.947185  normal  0.904932 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2280  twin-arginine translocation pathway signal  29.21 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000359779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5246  hypothetical protein  28.53 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5994  protein of unknown function DUF1501  26.78 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0048  protein of unknown function DUF1501  25.71 
 
 		 509 aa  90.1  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000158784  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1336  hypothetical protein  29.07 
 
 		 403 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000214784 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1959  hypothetical protein  28.12 
 
 		 406 aa  89.4  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.309737  normal  0.670033 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1850  hypothetical protein  28.21 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00703093 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6144  twin-arginine translocation pathway signal  27.8 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1789  protein of unknown function DUF1501  28.95 
 
 		 445 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1935  hypothetical protein  27.8 
 
 		 406 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.884799  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1005  hypothetical protein  31.86 
 
 		 388 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354968  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1923  hypothetical protein  28.12 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2238  hypothetical protein  27.95 
 
 		 399 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.729158  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7108  protein of unknown function DUF1501  27.49 
 
 		 524 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2448  hypothetical protein  30.33 
 
 		 390 aa  81.6  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.236933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1611  hypothetical protein  29.72 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00173364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2551  protein of unknown function DUF1501  28.68 
 
 		 399 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201136  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1205  hypothetical protein  39.42 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0167  protein of unknown function DUF1501  28.8 
 
 		 454 aa  73.2  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1974  hypothetical protein  30.37 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2116  protein of unknown function DUF1501  27.61 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0199943  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1451  hypothetical protein  27.61 
 
 		 410 aa  69.3  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3565  hypothetical protein  27.61 
 
 		 410 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1103  protein of unknown function DUF1501  27.18 
 
 		 454 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06463  hypothetical protein  25.86 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3364  hypothetical protein  30.99 
 
 		 565 aa  61.6  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.752802  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000085  DUF1501 domain-containing protein  24.72 
 
 		 441 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.40571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2473  protein of unknown function DUF1501  42.47 
 
 		 390 aa  55.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  decreased coverage  0.00457551 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2387  hypothetical protein  29.52 
 
 		 514 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3514  hypothetical protein  25.83 
 
 		 483 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0916385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1187  twin-arginine translocation pathway signal  30.87 
 
 		 448 aa  48.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000122909  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1448  protein of unknown function DUF1501  32.26 
 
 		 442 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1827  protein of unknown function DUF1501  41.11 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.456682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>