207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0419 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0419  DnaK suppressor protein  100 
 
 
126 aa  253  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.145678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0397  transcriptional regulator, TraR/DksA family  62.5 
 
 
348 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  62.3 
 
 
126 aa  156  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.14 
 
 
128 aa  144  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0703  TraR/DksA family transcriptional regulator  58.54 
 
 
126 aa  138  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383815  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0583  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.63 
 
 
127 aa  134  4e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02485  DnaK suppressor protein, putative  55.93 
 
 
128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  52.1 
 
 
259 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  52.38 
 
 
127 aa  113  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.45 
 
 
149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  47.11 
 
 
128 aa  103  6e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  40.16 
 
 
144 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.29 
 
 
145 aa  83.6  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.14 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.52 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.52 
 
 
144 aa  80.1  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.02 
 
 
147 aa  80.1  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.84 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.15 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 
138 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  57.14 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  57.14 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.88 
 
 
147 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.14 
 
 
142 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.1 
 
 
139 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  57.14 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.59 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  53.06 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  53.06 
 
 
138 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  55.1 
 
 
146 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  53.06 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.06 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.06 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3227  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.61 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3036  RNA polymerase-binding protein DksA  51.02 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0897126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3260  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.571876 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6416  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.36 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0580522  hitchhiker  0.0061347 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.83 
 
 
155 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  45.31 
 
 
228 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.9 
 
 
157 aa  52  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  53.06 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.21 
 
 
118 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.43 
 
 
120 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.5 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 
229 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.31 
 
 
275 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22720  DnaK suppressor protein  32.77 
 
 
153 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.432466  normal  0.0927989 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.8 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.8 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1950  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 
142 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  45.31 
 
 
162 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.96 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1731  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.31 
 
 
162 aa  50.4  0.000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.31 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0571  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 
134 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.73 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  43.75 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1457  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
164 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0280  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.36 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.171161  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.61 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.75 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0547  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4557  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.48 
 
 
257 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  33.62 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
138 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  31.2 
 
 
236 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  40.3 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2993  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.19 
 
 
223 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  42 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0256  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.06 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000917013  normal  0.0123355 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.06 
 
 
297 aa  48.1  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0808  TraR/DksA family transcriptional regulator  42.19 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.33 
 
 
228 aa  48.1  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>