183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02485 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02485  DnaK suppressor protein, putative  100 
 
 
128 aa  266  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0583  transcriptional regulator, TraR/DksA family  65.35 
 
 
127 aa  175  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0703  TraR/DksA family transcriptional regulator  68.33 
 
 
126 aa  175  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  55.08 
 
 
126 aa  136  1e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0419  DnaK suppressor protein  55.93 
 
 
126 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.145678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0397  transcriptional regulator, TraR/DksA family  50.86 
 
 
348 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  48.78 
 
 
259 aa  116  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.33 
 
 
128 aa  103  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  41.67 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  43.48 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.83 
 
 
127 aa  82.4  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.09 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.46 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
147 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.51 
 
 
144 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.46 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.23 
 
 
117 aa  60.1  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.62 
 
 
207 aa  53.5  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.06 
 
 
210 aa  52  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1736  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.03 
 
 
120 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.70977 
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  27.55 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0284  dnaK suppressor protein  30.7 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.2 
 
 
212 aa  51.6  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.48 
 
 
118 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09300  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.18 
 
 
228 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000204402  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  39.06 
 
 
147 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.73 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.8 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2611  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.46 
 
 
120 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.53 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.04 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4002  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.12 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.940246  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  38.71 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  29.84 
 
 
243 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.75 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4001  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.75 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000282354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
158 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.78 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22970  RNA polymerase-binding DksA like protein  31.53 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  48.98 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0196  transcriptional regulator, TraR/DksA family  37.17 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  48.98 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 
138 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  46.94 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2803  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.25 
 
 
253 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 
142 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1322  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.57 
 
 
216 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  37.5 
 
 
243 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 
138 aa  47.4  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0604  TraR/DksA family transcriptional regulator  52.5 
 
 
114 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5018  DksA/TraR family DNA-binding protein  37.5 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0497032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  46.94 
 
 
138 aa  46.2  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0212  conserved hypothetical protein, DksA-like protein  29.09 
 
 
118 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  46.94 
 
 
140 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4971  DNA binding protein, DksA/TraR family  37.5 
 
 
243 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
149 aa  47  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2440  transcriptional regulator, TraR/DksA family  29.7 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1418  TraR/DksA family transcriptional regulator  28.1 
 
 
133 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0975581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  46.94 
 
 
139 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  46.94 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2707  transcriptional regulator, TraR/DksA family  32.35 
 
 
133 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.5 
 
 
243 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1858  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.663069  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.9 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0293  transcriptional regulator, TraR/DksA family  28.1 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00672458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0249  DNA binding protein, DksA/TraR family  37.5 
 
 
243 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000818041  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4989  DNA binding protein, DksA/TraR family  35.94 
 
 
243 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0106572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0129  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.7 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  48.98 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.9 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  34.78 
 
 
157 aa  45.4  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4753  DksA/TraR family DNA-binding protein  35.94 
 
 
243 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000884601  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4591  DnaK suppressor protein  35.94 
 
 
243 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000615326  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2692  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.82 
 
 
297 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5114  dksa/trar family DNA-binding protein  35.94 
 
 
243 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000229995  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  25.21 
 
 
136 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2558  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4613  DnaK suppressor protein  35.94 
 
 
243 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000678403  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0568  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  37.88 
 
 
158 aa  44.7  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0565  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 
269 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.52 
 
 
139 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  34.57 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2760  DnaK suppressor protein  28.95 
 
 
118 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.19847e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1346  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.61 
 
 
126 aa  44.3  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.57 
 
 
158 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4537  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.71 
 
 
140 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.72 
 
 
109 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  41.51 
 
 
141 aa  44.3  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2345  TraR/DksA family transcriptional regulator  25.86 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283018  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73020  DksA/TraR family C4-type zinc finger protein  35.71 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450272  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>