219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0583 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0583  transcriptional regulator, TraR/DksA family  100 
 
 		 127 aa  258  1e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0703  TraR/DksA family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 126 aa  191  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.383815  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02485  DnaK suppressor protein, putative  65.35 
 
 		 128 aa  175  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.130728  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1597  DnaK suppressor protein, putative  60.17 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.638789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0419  DnaK suppressor protein  57.63 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.145678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0397  transcriptional regulator, TraR/DksA family  54.31 
 
 		 348 aa  121  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.411835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0141  DNAK suppressor protein  48.31 
 
 		 259 aa  107  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.130476 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5647  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.69 
 
 		 128 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2047  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.07 
 
 		 149 aa  99.4  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0429  hypothetical protein  45.69 
 
 		 128 aa  89.4  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3508  transcriptional regulator, TraR/DksA family  45.76 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1886  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.271081  decreased coverage  0.00232468 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0524  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1772  transcriptional regulator, TraR/DksA family  36.84 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000102348  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1990  TraR/DksA family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.4478  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0424  TraR/DksA family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00014325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.33 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000000577167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2286  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.4 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000387566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2904  TraR/DksA family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000908818  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1598  TraR/DksA family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0623  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0758  TraR/DksA family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 138 aa  53.5  0.0000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.193991  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2707  transcriptional regulator, TraR/DksA family  35.29 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0995  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3085  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0483117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1852  transcriptional regulator, TraR/DksA family  33.07 
 
 		 210 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.4009  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3255  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.290883  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0387  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0166  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.534243  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2917  RNA polymerase-binding protein DksA  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.123295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2172  DnaK suppressor protein  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.297381  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0192  RNA polymerase-binding protein DksA  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.426032  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0203  RNA polymerase-binding protein DksA  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3431  RNA polymerase-binding protein DksA  33.33 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2671  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 		 137 aa  50.4  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0417031  normal  0.389784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4637  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.367701  normal  0.092052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1132  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 138 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.807192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1192  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 158 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.890145  normal  0.628477 
 
 
-
 
NC_002620  TC0687  hypothetical protein  28.81 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.572586  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1113  DnaK suppressor protein DksA  53.06 
 
 		 136 aa  50.4  0.000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17474  normal  0.305826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5516  DnaK suppressor protein  53.06 
 
 		 133 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.596714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1499  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 138 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0747562 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1292  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.38 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359698  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6440  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3278  TraR/DksA family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000778936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16480  DnaK suppressor protein  28.81 
 
 		 236 aa  49.7  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.266038  normal  0.0407735 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1679  transcriptional regulators, TraR/DksA family  51.02 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0231267 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1346  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2476  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1419  TraR/DksA family transcriptional regulator  55.1 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3137  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3090  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1964  transcriptional regulator, TraR/DksA family  55.1 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.268781  normal  0.159362 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3107  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0071  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2999  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.141456 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4430  transcriptional regulator, TraR/DksA family  53.06 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0910  transcriptional regulator, TraR/DksA family  26.89 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2654  DnaK suppressor protein  32.04 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.562233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2847  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0799762  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3792  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0620628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1312  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4708  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0151479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0162  hypothetical protein  41.94 
 
 		 228 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3529  transcriptional regulator, TraR/DksA family  48.98 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0100266 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1082  transcriptional regulator, TraR/DksA family  27.18 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.151397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2122  TraR/DksA family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4379  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0344  transcriptional regulator, TraR/DksA family  31.25 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2467  RNA polymerase-binding protein DksA  53.06 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4193  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1002  RNA polymerase-binding protein DksA  51.02 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1036  dnaK suppressor protein  51.02 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.35343  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0138  putative dnaK suppressor protein  27.43 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.531735  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0486  transcriptional regulator, TraR/DksA family  44.9 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3687  TraR/DksA family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5556  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.398445  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0160  dnaK suppressor protein, putative  27.43 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.532233  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1427  TraR/DksA family transcriptional regulator  44 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0733302  normal  0.617985 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2176  transcriptional regulator, TraR/DksA family  51.02 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.0134623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5737  transcriptional regulator, TraR/DksA family  30.43 
 
 		 275 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.988125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2681  TraR/DksA family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.133444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1884  putative DnaK suppressor protein  46.03 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.261909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0126  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.138319 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3496  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 243 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000227563  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0096  transcriptional regulator, TraR/DksA family  34.38 
 
 		 207 aa  47.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0895  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 158 aa  47.8  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0120  dnaK suppressor protein, putative  27.43 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0934145  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1452  transcriptional regulator, TraR/DksA family  42.86 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0860961  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3387  putative dnaK suppressor protein  29.81 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.127508 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1939  TraR/DksA family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0082918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2595  TraR/DksA family transcriptional regulator  31 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1313  TraR/DksA family transcriptional regulator  35 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5000  DNA binding protein, DksA/TraR family  38.71 
 
 		 243 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0532379  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1953  TraR/DksA family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 143 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145281 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2014  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4700  TraR/DksA family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 243 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000265525  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0635  TraR/DksA family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0180  TraR/DksA family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000132063  normal  0.0556483 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1527  TraR/DksA family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143324  normal  0.735678 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>