61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0875 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  632  1e-180  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  70 
 
 		 320 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  70.19 
 
 		 322 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  63.75 
 
 		 320 aa  436  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  35.43 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  32.01 
 
 		 331 aa  135  8e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.46 
 
 		 289 aa  73.6  0.000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  32.43 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  32.86 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  31.19 
 
 		 368 aa  64.7  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  30.6 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.99 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  33.83 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 406 aa  54.7  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  32.21 
 
 		 374 aa  53.5  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  52.8  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 391 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.45 
 
 		 379 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  34.35 
 
 		 402 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  36.9 
 
 		 399 aa  50.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  35.59 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.12 
 
 		 390 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.97 
 
 		 408 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 376 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  37.65 
 
 		 413 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  31.01 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 408 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  30.6 
 
 		 375 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 373 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  35.64 
 
 		 401 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 		 395 aa  46.6  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 390 aa  46.6  0.0006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  29.46 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.45 
 
 		 400 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  33.09 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  27.11 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.3 
 
 		 391 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  32.48 
 
 		 376 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  32.54 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  32.11 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  30.22 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.11 
 
 		 413 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.37 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  26.11 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 411 aa  43.1  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.92 
 
 		 415 aa  43.1  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 389 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  33.98 
 
 		 397 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.47 
 
 		 332 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 		 400 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>