48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1596 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  635    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  67.5 
 
 		 320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  64.29 
 
 		 322 aa  431  1e-120  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  63.75 
 
 		 320 aa  421  1e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 331 aa  127  3e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.07 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.52 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  27.17 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  27.71 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 375 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.45 
 
 		 368 aa  54.3  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  29.79 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  29.79 
 
 		 376 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  33.63 
 
 		 374 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  30.99 
 
 		 399 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.07 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.37 
 
 		 373 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 377 aa  47  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  30.6 
 
 		 374 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 		 380 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  33.61 
 
 		 413 aa  46.6  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 370 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 415 aa  46.2  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 		 376 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 390 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  32.06 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 		 400 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.03 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  31.62 
 
 		 332 aa  44.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  33.66 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1650  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  25.83 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  36.05 
 
 		 401 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 418 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.51 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  23.61 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  23.61 
 
 		 353 aa  42.7  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.49 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  26.53 
 
 		 360 aa  42.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  32.76 
 
 		 373 aa  42.4  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>