55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0634 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  635    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  70.19 
 
 		 320 aa  464  1e-129  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  64.29 
 
 		 320 aa  431  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  70.19 
 
 		 320 aa  434  1e-120  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 331 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.01 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  26.3 
 
 		 332 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  30.12 
 
 		 289 aa  70.1  0.00000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 387 aa  69.3  0.00000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 		 329 aa  60.8  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  31.33 
 
 		 376 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.42 
 
 		 380 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  23.91 
 
 		 379 aa  52.8  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.83 
 
 		 373 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.19 
 
 		 380 aa  50.4  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  32.31 
 
 		 379 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  33.08 
 
 		 374 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.77 
 
 		 341 aa  49.3  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.25 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 370 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  29.14 
 
 		 379 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 376 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  30.1 
 
 		 401 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  30.65 
 
 		 391 aa  47.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 378 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.79 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  31.11 
 
 		 373 aa  46.2  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.99 
 
 		 332 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 375 aa  45.8  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  36.79 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.85 
 
 		 402 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  36.46 
 
 		 413 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.51 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.31 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 		 394 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.65 
 
 		 408 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  25.17 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  29.75 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 		 406 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  31.78 
 
 		 400 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  24.61 
 
 		 380 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  31.4 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  32.46 
 
 		 406 aa  43.5  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  25.53 
 
 		 380 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  26.32 
 
 		 377 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  32.71 
 
 		 374 aa  43.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.67 
 
 		 468 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 380 aa  43.1  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.6 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  35.23 
 
 		 399 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 365 aa  42.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  32.46 
 
 		 406 aa  42.4  0.01  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>