48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0627 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  635    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  67.5 
 
 		 320 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  70.19 
 
 		 322 aa  464  1e-129  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  70 
 
 		 320 aa  438  9.999999999999999e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.23 
 
 		 331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  36.4 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  32.28 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.57 
 
 		 289 aa  63.5  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 329 aa  59.7  0.00000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  24.73 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  31.87 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  30.05 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 379 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 380 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.88 
 
 		 368 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  34.45 
 
 		 341 aa  48.9  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  29.65 
 
 		 380 aa  48.9  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  30.88 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  33.83 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.84 
 
 		 375 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  28.65 
 
 		 376 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.92 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  31.11 
 
 		 376 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  28.28 
 
 		 370 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  36.3 
 
 		 413 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.63 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  31.65 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.98 
 
 		 395 aa  44.3  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 401 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 406 aa  44.3  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  29.77 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 391 aa  44.3  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2172  geranylgeranyl reductase  29.19 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.328813  decreased coverage  0.000000000712182 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2544  geranylgeranyl reductase family protein  29.19 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  30.81 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  30.81 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  31.08 
 
 		 425 aa  43.5  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  35.92 
 
 		 400 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  35.92 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  34.34 
 
 		 405 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  39.39 
 
 		 363 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2102  monooxygenase FAD-binding  40.38 
 
 		 340 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>