10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0359 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 		 332 aa  679    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  25.62 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.37 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.86 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  27.49 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  28.99 
 
 		 322 aa  46.2  0.0008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  31.62 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  27.13 
 
 		 407 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>