99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1036 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  33.11 
 
 		 329 aa  138  1e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  38.27 
 
 		 289 aa  136  3.0000000000000003e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  32.93 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  32.28 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  29.37 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  40 
 
 		 403 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 		 368 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.09 
 
 		 446 aa  61.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25.62 
 
 		 332 aa  61.2  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  27.17 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  32.43 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29 
 
 		 446 aa  59.3  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.36 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  28.32 
 
 		 449 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  27.95 
 
 		 468 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  24.65 
 
 		 396 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 384 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 		 394 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  25.21 
 
 		 394 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.54 
 
 		 398 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 405 aa  52.8  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 413 aa  52  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  34.07 
 
 		 445 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  32.7 
 
 		 452 aa  50.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  24.55 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.44 
 
 		 380 aa  50.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 401 aa  49.7  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 341 aa  49.7  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  32.85 
 
 		 379 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.82 
 
 		 379 aa  48.5  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  27.57 
 
 		 402 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 390 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  32.39 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  33.06 
 
 		 398 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  35.77 
 
 		 406 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  36.08 
 
 		 400 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0862  geranylgeranyl reductase  37.62 
 
 		 387 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  32.9 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  32.9 
 
 		 405 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 443 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  33.53 
 
 		 443 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  36.08 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  37 
 
 		 400 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 375 aa  47  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  28.93 
 
 		 384 aa  46.6  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 397 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  34.55 
 
 		 401 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  32.7 
 
 		 455 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 435 aa  46.2  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 380 aa  45.8  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  24.63 
 
 		 390 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  27.35 
 
 		 388 aa  45.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.91 
 
 		 424 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  33.02 
 
 		 408 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 393 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.67 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 408 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 376 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 390 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  30.43 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  28.57 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  36.63 
 
 		 394 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  32.08 
 
 		 405 aa  44.3  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.26 
 
 		 402 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2871  monooxygenase FAD-binding protein  25.5 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.618134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 408 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  28.65 
 
 		 398 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  33.93 
 
 		 429 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 386 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  30.94 
 
 		 463 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 		 380 aa  43.1  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  29.63 
 
 		 420 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  27.46 
 
 		 409 aa  43.1  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  29.1 
 
 		 406 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 390 aa  42.7  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.26 
 
 		 418 aa  43.1  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  33.61 
 
 		 376 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 330 aa  42.7  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  34.74 
 
 		 393 aa  42.7  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  27.5 
 
 		 410 aa  42.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  28.77 
 
 		 418 aa  42.7  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  26.55 
 
 		 411 aa  42.7  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 369 aa  42.7  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 		 382 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 443 aa  42.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  33.91 
 
 		 415 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 423 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  32.35 
 
 		 430 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 407 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>