59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0160 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 332 aa  671    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  57.27 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  37.95 
 
 		 289 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  30.15 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 331 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  27.12 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  26.3 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  27.76 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  25.45 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  24.32 
 
 		 374 aa  62.4  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  27.78 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0783  monooxygenase, FAD-binding  26.71 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  24.73 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  25.72 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  28.72 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0732  hypothetical protein  25.91 
 
 		 358 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  25.26 
 
 		 377 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23.47 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.05 
 
 		 390 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  24.52 
 
 		 405 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 		 375 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.85 
 
 		 377 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2063  hypothetical protein  29.58 
 
 		 363 aa  49.7  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05221  NAD binding site  23.18 
 
 		 375 aa  49.3  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  25.54 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 		 405 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  25.58 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  23.7 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  23.81 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.75 
 
 		 370 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  24.49 
 
 		 368 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 390 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 1410 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0709  geranylgeranyl reductase  20.89 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0840  monooxygenase FAD-binding  25.91 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.634419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 406 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 396 aa  46.6  0.0007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.29 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.19 
 
 		 396 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  21.63 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0031  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.08 
 
 		 264 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  20.77 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  23.75 
 
 		 384 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 391 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  26.6 
 
 		 358 aa  43.9  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  22.15 
 
 		 407 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  23.2 
 
 		 418 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.09 
 
 		 382 aa  43.1  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  32.38 
 
 		 483 aa  43.1  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.41 
 
 		 398 aa  43.1  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.29 
 
 		 1440 aa  43.1  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.05 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 373 aa  42.7  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2314  respiratory-chain NADH dehydrogenase, 51 kDa subunit  25.3 
 
 		 707 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0653639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.22 
 
 		 1440 aa  42.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>