20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1085 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  100 
 
 		 289 aa  582  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  37.95 
 
 		 332 aa  200  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  39.31 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  38.27 
 
 		 297 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  30.12 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  27.57 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  28.52 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  27.57 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.67 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.73 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0399  FAD dependent oxidoreductase  26.04 
 
 		 357 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0918847  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 367 aa  48.5  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  27.15 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  29.32 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  32.62 
 
 		 376 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.93 
 
 		 360 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 374 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1933  hypothetical protein  28.74 
 
 		 358 aa  42.4  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1058  HI0933 family protein  27.6 
 
 		 425 aa  42.4  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>