53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0240 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 159 aa  317  6e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  62.89 
 
 		 159 aa  209  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  42.77 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 158 aa  133  8e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  130  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  40.25 
 
 		 158 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  40.88 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  41.4 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  40.88 
 
 		 158 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  40.88 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  38.99 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  38.61 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  39.49 
 
 		 158 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  35.85 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  35.53 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  34.9 
 
 		 166 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  34.21 
 
 		 163 aa  99.8  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  32.5 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  29.81 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  29.38 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  29.19 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.28 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  26.28 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  26.28 
 
 		 178 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  25.64 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  30.63 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  28.38 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  25 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  28.12 
 
 		 170 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  26.14 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  30.82 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  23.03 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  23.03 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  28.35 
 
 		 174 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  24.18 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  26.57 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  26.52 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  38.89 
 
 		 230 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  25.93 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  26.83 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  26.83 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  24.79 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  26.72 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  26.83 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  26.02 
 
 		 168 aa  41.6  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  23.72 
 
 		 177 aa  40.8  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>