68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0178 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 158 aa  319  9.000000000000001e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  70.89 
 
 		 158 aa  239  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  70.25 
 
 		 158 aa  238  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  69.62 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  69.62 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  67.72 
 
 		 158 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  68.99 
 
 		 158 aa  230  7.000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  66.46 
 
 		 158 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  65.19 
 
 		 158 aa  226  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  64.56 
 
 		 158 aa  224  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  65.82 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  64.56 
 
 		 158 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  63.92 
 
 		 158 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  62.66 
 
 		 158 aa  212  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  62.03 
 
 		 158 aa  209  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  59.49 
 
 		 158 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  40 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  39.49 
 
 		 159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  32.69 
 
 		 163 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  31.58 
 
 		 164 aa  111  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  32.47 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  31.87 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  38.99 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  31.65 
 
 		 164 aa  89.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  30 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  31.01 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  31.01 
 
 		 160 aa  82  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  32.68 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  26.32 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  30.63 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  28.93 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  29.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  28.67 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  29.33 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  28 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  27.89 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  28.68 
 
 		 202 aa  63.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  27.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  27.33 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.8 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  27.94 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  26.38 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  27.03 
 
 		 168 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  28.91 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  28.91 
 
 		 168 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  28.12 
 
 		 168 aa  51.2  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  51.2  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  26.03 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  26.03 
 
 		 168 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  27.34 
 
 		 168 aa  50.8  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  25.16 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  24.19 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  26.49 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  23.39 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  24.64 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  23.36 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.62 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24.62 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  28.03 
 
 		 172 aa  43.9  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2585  general secretion pathway M protein  22.95 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  25.38 
 
 		 165 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  24.38 
 
 		 177 aa  41.2  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>