50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03965 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 159 aa  322  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  62.89 
 
 		 159 aa  190  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  41.51 
 
 		 158 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  40.65 
 
 		 156 aa  130  9e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  40.25 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  41.4 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  39.49 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 158 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  33.76 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  36.84 
 
 		 158 aa  115  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  37.34 
 
 		 158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  35.53 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  36.18 
 
 		 158 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  29.41 
 
 		 166 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  30.63 
 
 		 163 aa  87  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  26.71 
 
 		 164 aa  82.8  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  27.92 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  27.33 
 
 		 164 aa  82  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  27.45 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  27.61 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  24.83 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  24.16 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  24.16 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  24.16 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  24.16 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  31.13 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  23.49 
 
 		 178 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  23.49 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  26.99 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  25 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  26.92 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  26.62 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  27.56 
 
 		 174 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  20.81 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  24.53 
 
 		 177 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  21.48 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  22.07 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  22.07 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  25.66 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  26.39 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  24.78 
 
 		 189 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  26.83 
 
 		 188 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  23.01 
 
 		 192 aa  42  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  26.45 
 
 		 202 aa  41.6  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>