49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2851 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 164 aa  328  2e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  89.02 
 
 		 164 aa  296  6e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  54.37 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  56.88 
 
 		 162 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  40.12 
 
 		 170 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  36.71 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  33.75 
 
 		 158 aa  94.4  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  32.5 
 
 		 158 aa  92  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  33.75 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  31.17 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  33.54 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  33.54 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  31.87 
 
 		 158 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  31.17 
 
 		 163 aa  86.7  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  32.91 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  32.91 
 
 		 158 aa  84.3  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  32.5 
 
 		 158 aa  84  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  32.5 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  31.01 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  27.33 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  30.57 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  32.1 
 
 		 163 aa  81.6  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  27.27 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  29.19 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  28.48 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  32.9 
 
 		 158 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  32.08 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  25.81 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  30.19 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  30.19 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  30.19 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  27.52 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.94 
 
 		 174 aa  51.2  0.000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  31.45 
 
 		 164 aa  48.5  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  31.39 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2585  general secretion pathway M protein  29.6 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  25 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  25 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  25 
 
 		 168 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  26.06 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  26.06 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  26.06 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  26.06 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  20.16 
 
 		 165 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24.39 
 
 		 168 aa  41.2  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>