21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2585 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2585  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 168 aa  326  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  25.35 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  27.78 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  26.06 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  26.06 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  26.06 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  25.35 
 
 		 158 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  28.89 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  24.65 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  23.94 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  25.35 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  24.31 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  22.54 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  27.66 
 
 		 164 aa  44.7  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  23.94 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  29.37 
 
 		 178 aa  42  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  28.67 
 
 		 178 aa  41.2  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  26.17 
 
 		 162 aa  40.8  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>