71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0160 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 158 aa  319  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 158 aa  319  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  99.37 
 
 		 158 aa  317  3.9999999999999996e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  98.1 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  91.77 
 
 		 158 aa  300  5.000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  90.51 
 
 		 158 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  88.61 
 
 		 158 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  91.14 
 
 		 158 aa  291  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  87.97 
 
 		 158 aa  289  1e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  73.42 
 
 		 158 aa  244  4e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  74.05 
 
 		 158 aa  243  8e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  70.89 
 
 		 158 aa  240  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  69.62 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  69.62 
 
 		 158 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  68.99 
 
 		 158 aa  229  8.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  67.09 
 
 		 158 aa  224  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  46.45 
 
 		 156 aa  150  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  39.62 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  39.62 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  32.26 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  30.91 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  31.9 
 
 		 164 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  31.68 
 
 		 163 aa  98.2  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  30.38 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  31.65 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 162 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  32.91 
 
 		 164 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  29.41 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  31.45 
 
 		 164 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  29.61 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  29.61 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  29.61 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  70.5  0.000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  28.95 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  28.95 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  28.29 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  28.29 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  29.45 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  30.71 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  27.4 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  27.67 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  30.52 
 
 		 172 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2585  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  26.98 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  26.98 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  26.98 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  26.19 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  25.83 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  25.83 
 
 		 189 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  24.6 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  24.6 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0324  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.81 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 		 175 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24.81 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  22.95 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  25.36 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  24.22 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  27.52 
 
 		 165 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  26.28 
 
 		 167 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  28.21 
 
 		 177 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03021  orotate phosphoribosyltransferase  33 
 
 		 194 aa  41.2  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  decreased coverage  0.0000452779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  22.66 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  22.66 
 
 		 167 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>