53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3227 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  77.01 
 
 		 188 aa  269  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  57.67 
 
 		 192 aa  178  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  63.03 
 
 		 189 aa  171  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  63.03 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  43.48 
 
 		 175 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  43.48 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  43.48 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  43.48 
 
 		 168 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  43.48 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  43.48 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  43.48 
 
 		 168 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  40.79 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  40.79 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  42.86 
 
 		 168 aa  111  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  40.12 
 
 		 167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 168 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  40.79 
 
 		 168 aa  109  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  40.13 
 
 		 168 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  40.26 
 
 		 167 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  40.79 
 
 		 168 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  38.92 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.14 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  29.45 
 
 		 158 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  29.45 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  29.45 
 
 		 158 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  28.77 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  28.68 
 
 		 158 aa  63.9  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  27.4 
 
 		 158 aa  62  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  28.29 
 
 		 158 aa  62  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  29.41 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  28.15 
 
 		 158 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  26.28 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  25.83 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  24.5 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  25.34 
 
 		 158 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  24.66 
 
 		 158 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  31.55 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  30 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  30.2 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  21.52 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  25.17 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  28.4 
 
 		 164 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  25.16 
 
 		 164 aa  45.4  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  22.31 
 
 		 156 aa  45.4  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3425  general secretion pathway M protein  33.13 
 
 		 170 aa  44.7  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000548407 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  25.31 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  25.31 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3176  general secretion pathway M protein  27.33 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317851  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  23.68 
 
 		 164 aa  42  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  26.45 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>