69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0158 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 158 aa  322  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  99.37 
 
 		 158 aa  320  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  96.2 
 
 		 158 aa  310  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  94.94 
 
 		 158 aa  305  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  89.24 
 
 		 158 aa  294  3e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  88.61 
 
 		 158 aa  293  8e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  88.61 
 
 		 158 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  88.61 
 
 		 158 aa  291  2e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  87.97 
 
 		 158 aa  287  3e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  72.15 
 
 		 158 aa  239  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  70.89 
 
 		 158 aa  236  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  70.89 
 
 		 158 aa  235  2e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  68.99 
 
 		 158 aa  232  2.0000000000000002e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  65.19 
 
 		 158 aa  226  7e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  68.99 
 
 		 158 aa  225  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  66.46 
 
 		 158 aa  221  3e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  42.58 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  40.25 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  40.88 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  29.49 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  32.12 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  29.63 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  29.63 
 
 		 163 aa  90.5  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  32.5 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 164 aa  87  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  28.03 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  29.22 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  29.56 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  27.39 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  27.45 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  28.29 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  27.39 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  27.33 
 
 		 178 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  27.33 
 
 		 178 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  27.1 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.11 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  28.93 
 
 		 170 aa  60.8  0.000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  26.53 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  32.28 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  25.34 
 
 		 202 aa  57  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0324  hypothetical protein  31.53 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2585  general secretion pathway M protein  26.23 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  26.5 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  26.5 
 
 		 168 aa  47.8  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  26.98 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  26.98 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  29.49 
 
 		 177 aa  47.4  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  26.19 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  26.19 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  23.77 
 
 		 174 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24.22 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  25.78 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.22 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  23.44 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  23.44 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  23.44 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  23.44 
 
 		 175 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  25.17 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  26.62 
 
 		 189 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  27.92 
 
 		 172 aa  44.3  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  23.81 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  25.31 
 
 		 167 aa  41.6  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  25.36 
 
 		 192 aa  41.2  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2648  hypothetical protein  25.33 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>