48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00610 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 164 aa  332  2e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  92.02 
 
 		 163 aa  308  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  53.94 
 
 		 166 aa  196  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  58.23 
 
 		 163 aa  190  8e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  36.36 
 
 		 158 aa  123  9e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  31.58 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  29.87 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  31.37 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  32.89 
 
 		 156 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  30.86 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  30.86 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  31.9 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  31.9 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  100  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  100  7e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  31.29 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  31.29 
 
 		 158 aa  97.8  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  97.1  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  33.12 
 
 		 164 aa  94.4  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  35.53 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  31.17 
 
 		 164 aa  88.2  5e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  31.54 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  30.41 
 
 		 178 aa  85.9  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  31.54 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  31.54 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  29.75 
 
 		 160 aa  84  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  30.41 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  30.41 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  30.87 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  27.92 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  27.81 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  27.56 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  28.85 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  26.49 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  24.68 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  27.89 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  25 
 
 		 165 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  26.67 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  23.68 
 
 		 202 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3528  general secretion pathway protein M  23.24 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952815  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0379  General secretion pathway M protein  22.96 
 
 		 153 aa  42  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03185  general secretory pathway component, cryptic  22.96 
 
 		 153 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03136  hypothetical protein  22.96 
 
 		 153 aa  42  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0379  general secretion pathway M protein  22.96 
 
 		 153 aa  42  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.717052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  23.36 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>