53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2384 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 164 aa  313  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  42.77 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  45.62 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  30.07 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  32.5 
 
 		 158 aa  79  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  29.56 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  31.87 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  28.93 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  31.45 
 
 		 172 aa  73.2  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  30.82 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  30 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  29.56 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  29.38 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  32.28 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  28.93 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  29.38 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  27.74 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  28.93 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  28.83 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  30.19 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  34.71 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  31.41 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  30.82 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  26.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  30.13 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  28.85 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  30.13 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  35.4 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  28.83 
 
 		 166 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  31.21 
 
 		 162 aa  52.4  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  23.93 
 
 		 167 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  28.85 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  26.97 
 
 		 163 aa  50.4  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  26.67 
 
 		 164 aa  50.4  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  29.3 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  27.39 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1038  hypothetical protein  29.11 
 
 		 184 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24100  general secretion pathway protein M  34.38 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000242731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  25.64 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  27.54 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  27.95 
 
 		 188 aa  44.3  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  29.34 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  28.48 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  27.91 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  35.03 
 
 		 174 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  28.99 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  36.79 
 
 		 197 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>