29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0150 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 172 aa  340  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  31.45 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  29.25 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  32.5 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  30.52 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  30.52 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  31.37 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  29.87 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  28.86 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.22 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  30 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 158 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  29.49 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  28.57 
 
 		 158 aa  47.4  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  25 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  27.88 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  29.87 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  27.92 
 
 		 158 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  28.03 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  24.07 
 
 		 156 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  27.92 
 
 		 158 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  25 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  28.85 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  28 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  23.46 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  28 
 
 		 168 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  26.03 
 
 		 162 aa  42  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  23.6 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  29.24 
 
 		 163 aa  41.2  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>