26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1840 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  317  3e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  98.08 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  24.31 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  24.31 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  23.13 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  23.81 
 
 		 178 aa  57.4  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  25.81 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  21.62 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  25 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  25 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  20.62 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  25 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  25.85 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  21.05 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  24.5 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  25.81 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  22.07 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  24.83 
 
 		 162 aa  45.1  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  22.22 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  21.43 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  23.46 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  21.33 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  22.15 
 
 		 163 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  19.61 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  21.33 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>