63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0728 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 178 aa  364  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  95.51 
 
 		 178 aa  352  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  94.94 
 
 		 178 aa  350  7e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  94.94 
 
 		 178 aa  350  7e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  94.38 
 
 		 178 aa  348  2e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  94.38 
 
 		 178 aa  347  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  92.13 
 
 		 178 aa  339  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  31.54 
 
 		 164 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  32 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  30.87 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  24.16 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.61 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  29.61 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  29.61 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  28.29 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  28.67 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  28.95 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  28.95 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  28.29 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  28.67 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  28.29 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  26.28 
 
 		 159 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  26.9 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  31.45 
 
 		 164 aa  67  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  28.28 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  28.38 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  29.33 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  30.52 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  30.15 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  28.35 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  27.66 
 
 		 156 aa  63.9  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  26.17 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  32.08 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  29.53 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  23.81 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  23.81 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  26.85 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  26.67 
 
 		 168 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  28.12 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  27.1 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  26.57 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  25.33 
 
 		 168 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  27.15 
 
 		 168 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  26.85 
 
 		 162 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  24.65 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  24.67 
 
 		 168 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  27.27 
 
 		 174 aa  44.3  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  25.47 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  24.18 
 
 		 167 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24 
 
 		 175 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  42  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24 
 
 		 175 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  24.84 
 
 		 167 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  27.27 
 
 		 189 aa  41.2  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  27.27 
 
 		 189 aa  41.6  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24 
 
 		 168 aa  41.2  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>