51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1308 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  75.62 
 
 		 162 aa  255  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  56.88 
 
 		 164 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  55.28 
 
 		 164 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  40.51 
 
 		 170 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  30.63 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  31.25 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  28.4 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.63 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  28.75 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  29.49 
 
 		 163 aa  78.2  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  28.85 
 
 		 164 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  26.99 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  30.43 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  29.41 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  30.63 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  27.71 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  27.16 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  25 
 
 		 156 aa  68.2  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  25.83 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  33.1 
 
 		 174 aa  54.3  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  26.85 
 
 		 178 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  27.56 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  26.85 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  26.85 
 
 		 178 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.85 
 
 		 178 aa  51.6  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  32.26 
 
 		 158 aa  51.2  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 		 178 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  25.81 
 
 		 162 aa  48.9  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 164 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 174 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  25.5 
 
 		 178 aa  47.4  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  23.23 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  23.23 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24.03 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24.03 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.03 
 
 		 168 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.03 
 
 		 175 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.03 
 
 		 168 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24.03 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24.03 
 
 		 175 aa  42  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>