50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0106 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  100 
 
 		 160 aa  310  4.999999999999999e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  32.91 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  30.38 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  30.38 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  30.38 
 
 		 158 aa  94.7  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  29.75 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  29.75 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  29.75 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  31.01 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  29.11 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  28.03 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  31.01 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  28.03 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  29.75 
 
 		 164 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  29.68 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  29.11 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  29.11 
 
 		 158 aa  87  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  33.55 
 
 		 159 aa  85.9  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  27.85 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  29.11 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  28.48 
 
 		 164 aa  77  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  27.85 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  26.62 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  29.11 
 
 		 163 aa  73.6  0.0000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  28.38 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  27.89 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  27.89 
 
 		 178 aa  70.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  27.21 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  27.15 
 
 		 164 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  27.21 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  27.89 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  27.21 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  27.89 
 
 		 178 aa  68.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  23.84 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  25.83 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  28.4 
 
 		 167 aa  47.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  25.31 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.18 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  27.16 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24.18 
 
 		 168 aa  45.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24.18 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  20.78 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  27.1 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  24.5 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  24.5 
 
 		 168 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>