36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3946 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 167 aa  329  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  92.81 
 
 		 167 aa  311  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  82.63 
 
 		 167 aa  281  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  71.43 
 
 		 168 aa  247  5e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  73.21 
 
 		 168 aa  246  8e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  72.62 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  72.62 
 
 		 168 aa  246  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  72.02 
 
 		 168 aa  245  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  72.02 
 
 		 168 aa  244  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  70.55 
 
 		 168 aa  238  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  70.73 
 
 		 168 aa  235  2e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  70.12 
 
 		 175 aa  234  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  70.12 
 
 		 168 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  70.12 
 
 		 168 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  70.12 
 
 		 168 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  70.12 
 
 		 175 aa  234  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  70.12 
 
 		 168 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  70.12 
 
 		 168 aa  233  6e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  40.12 
 
 		 202 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  41.18 
 
 		 192 aa  107  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  40.25 
 
 		 188 aa  97.8  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  41.72 
 
 		 189 aa  97.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  41.72 
 
 		 189 aa  96.7  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  26.54 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  24.19 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  31.13 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  27.34 
 
 		 197 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  24.18 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  22.29 
 
 		 166 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  27.27 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  22.66 
 
 		 158 aa  41.6  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  22.66 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  22.66 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  22.13 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  24.18 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  24.18 
 
 		 178 aa  40.8  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>