52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1479 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  100 
 
 		 162 aa  330  7.000000000000001e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  75.62 
 
 		 162 aa  236  1e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  53.75 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  54.37 
 
 		 164 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  40.12 
 
 		 170 aa  111  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  91.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  32.1 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  88.2  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  30.86 
 
 		 158 aa  87.4  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  30.86 
 
 		 158 aa  87.4  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  30.06 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  30 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  84.3  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  28.22 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  27.16 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  29.38 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 158 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  27.61 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  32.3 
 
 		 163 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  27.56 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  27.45 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  28.21 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  22.01 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  26.85 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  23.84 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  27.52 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.85 
 
 		 178 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  27.52 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  26.85 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  33.55 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  33.1 
 
 		 174 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  24.84 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1837  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0259  general secretion pathway M protein  24.49 
 
 		 167 aa  44.7  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.510842  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  21.09 
 
 		 167 aa  43.9  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  31.21 
 
 		 164 aa  43.1  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  24.53 
 
 		 168 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  24.53 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  24.53 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  24.53 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  24.53 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  24.53 
 
 		 168 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  24.53 
 
 		 175 aa  42  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>