46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001883 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  100 
 
 		 163 aa  326  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  92.02 
 
 		 164 aa  308  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  53.05 
 
 		 166 aa  189  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  55.7 
 
 		 163 aa  184  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  35.06 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  32.69 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  31.82 
 
 		 158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  32.03 
 
 		 158 aa  107  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  31.48 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  32.24 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  32.1 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  98.2  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  31.68 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  31.68 
 
 		 158 aa  98.2  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  31.68 
 
 		 158 aa  97.4  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  30 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  31.06 
 
 		 158 aa  96.3  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  30.25 
 
 		 158 aa  95.1  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  33.33 
 
 		 164 aa  94  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  94  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  29.63 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  34.21 
 
 		 159 aa  88.2  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  31.17 
 
 		 164 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  31.41 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  30.41 
 
 		 178 aa  84  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  30.87 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  31.08 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  31.08 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  30.87 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  30.87 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  27.45 
 
 		 159 aa  81.3  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  30.2 
 
 		 178 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  28.49 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  29.49 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  28.21 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  25.97 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  29.25 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  26.67 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  25.34 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  25.98 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  26.97 
 
 		 164 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  24.82 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  30.91 
 
 		 174 aa  41.2  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0150  General secretion pathway M protein  29.24 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  23.68 
 
 		 202 aa  40.8  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>