27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0390 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  100 
 
 
165 aa  317  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  28.74 
 
 
166 aa  58.2  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  30.67 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  27.03 
 
 
164 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  26.85 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  28 
 
 
158 aa  50.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  26.53 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  24.49 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  27.33 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  27.27 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  27.52 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  27.52 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  28.08 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  24.49 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  25.85 
 
 
158 aa  48.5  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  25.17 
 
 
158 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  25.66 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  21.71 
 
 
164 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  26.35 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  25.17 
 
 
158 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  26.17 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  30.91 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  24.66 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  25.38 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  20.16 
 
 
164 aa  42.4  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  21.47 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  23.87 
 
 
163 aa  40.8  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>