45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1357 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1357  general secretion pathway M protein  100 
 
 
177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2038  general secretion pathway protein M  36.57 
 
 
174 aa  84  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  32.61 
 
 
174 aa  80.5  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0237  General secretion pathway M protein  33.13 
 
 
158 aa  76.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2384  general secretion pathway M protein  35.33 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000664832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4582  general secretion pathway protein M  24.52 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  28.19 
 
 
166 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03965  general secretion pathway protein M  25.16 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  26.32 
 
 
158 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  25 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24100  general secretion pathway protein M  34.86 
 
 
174 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000242731  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  26.45 
 
 
158 aa  60.8  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  23.75 
 
 
158 aa  59.7  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  25 
 
 
158 aa  57.8  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  23.68 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001883  general secretion pathway protein M  23.38 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  23.68 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  23.68 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  23.03 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3571  hypothetical protein  25.49 
 
 
162 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.614114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  23.68 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  23.68 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2917  general secretion pathway M protein  34.15 
 
 
174 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0977203 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  23.03 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00610  general secretion pathway protein M  23.38 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  22.37 
 
 
158 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1479  General secretion pathway M protein  26.04 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0240  general secretion pathway M protein  23.46 
 
 
159 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.321441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  23.03 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  23.03 
 
 
158 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  24.38 
 
 
158 aa  52  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2915  general secretion pathway protein M  27.54 
 
 
163 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  24.16 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  24.16 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2851  General secretion pathway M protein  26.04 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  25.44 
 
 
164 aa  48.9  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0012  EtpM  29.65 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.804249 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0390  general secretion pathway M protein  29.45 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.383902 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  23.49 
 
 
178 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1407  general secretion pathway protein M  34.07 
 
 
155 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0117156  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0106  general secretion pathway M protein  23.49 
 
 
160 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  24.16 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1308  General secretion pathway M protein  29.59 
 
 
162 aa  44.7  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  22.15 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1840  hypothetical protein  16.35 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>