51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_0053 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  100 
 
 
168 aa  337  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  88.69 
 
 
168 aa  301  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  86.9 
 
 
168 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  86.9 
 
 
168 aa  297  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  86.31 
 
 
168 aa  297  5e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  86.9 
 
 
168 aa  296  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  86.31 
 
 
168 aa  294  5e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  80.95 
 
 
168 aa  273  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  80.36 
 
 
168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  80.36 
 
 
168 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  80.36 
 
 
175 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  79.76 
 
 
168 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  79.76 
 
 
168 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  79.76 
 
 
168 aa  271  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  79.76 
 
 
175 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4491  putative general secretory pathway protein M  70.55 
 
 
167 aa  239  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.584495  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  70.55 
 
 
167 aa  238  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  71.15 
 
 
167 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  40.51 
 
 
192 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  40.79 
 
 
202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  40.26 
 
 
188 aa  102  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3397  General secretion pathway M protein  40.65 
 
 
189 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  40.65 
 
 
189 aa  101  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55460  type II secretion system protein  32.41 
 
 
197 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000029628  normal  0.0351347 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4725  general secretion pathway M protein  29.6 
 
 
158 aa  51.6  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2297  cholera toxin secretion protein EpsM  24.66 
 
 
166 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0728  General secretion pathway M protein  26.67 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0178  general secretion pathway protein M  27.34 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0577682  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02778  hypothetical protein  28 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000246305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02829  predicted secretion pathway M-type protein, membrane anchored  28 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000034154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3238  putative general secretion pathway protein YghD  26.17 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.310294  normal  0.927971 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0160  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0160  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0165  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0175  general secretion pathway protein M  25.4 
 
 
158 aa  47.4  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0158  general secretion pathway M protein  26.19 
 
 
158 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  27.11 
 
 
163 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1421  General secretion pathway M protein  26.11 
 
 
164 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2387  general secretion pathway M protein  29.38 
 
 
174 aa  46.6  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0114  general secretion pathway M protein  26.4 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3418  putative general secretion pathway protein YghD  25.33 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3129  putative general secretion pathway protein YghD  25.33 
 
 
178 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4349  general secretion pathway M protein  26.77 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.482312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0163  General secretion pathway M protein  25.4 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4197  general secretion pathway M protein  26.19 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3610  general secretion pathway M protein  24.8 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0162  general secretion pathway M protein  25.4 
 
 
158 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0482645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0153  general secretion pathway M protein  25.41 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.122002  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3558  general secretion pathway M protein  24.81 
 
 
158 aa  42  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3403  putative general secretion pathway protein YghD  24.67 
 
 
178 aa  42  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0130  general secretion pathway M protein  26.89 
 
 
158 aa  40.8  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>