22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1892 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1892  general secretion pathway M protein  100 
 
 
163 aa  330  7.000000000000001e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3390  general secretion pathway M protein  32.93 
 
 
188 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3227  general secretion pathway M protein  31.55 
 
 
202 aa  53.9  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243519  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0052  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 
168 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563062  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0042  general secretion pathway M protein  29.01 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3946  General secretion pathway M protein  26.54 
 
 
167 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.487407  normal  0.51049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3080  general secretion pathway M protein  26.54 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.233013  hitchhiker  0.000000230148 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0052  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0147385  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0018  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 
168 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00637635  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0053  general secretion pathway M protein  27.11 
 
 
168 aa  47  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.771859  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3112  general secretory pathway M transmembrane protein  31.55 
 
 
192 aa  47  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0071  general secretion pathway M protein  27.16 
 
 
168 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434377  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0230  general secretory pathway protein M  27.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0018  general secretory pathway protein M  27.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687218  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0018  general secretory pathway protein M  27.06 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.563775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2672  general secretion pathway protein M  27.06 
 
 
175 aa  44.3  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.126224  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2775  general secretion pathway protein M  27.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1880  general secretion pathway protein M  27.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121479  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3508  general secretion pathway protein M  27.44 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.928199  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0017  general secretion pathway protein M  27.06 
 
 
168 aa  44.3  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3234  general secretion pathway M protein  27.78 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.108205  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3050  General secretion pathway M protein  27.74 
 
 
189 aa  40.8  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.242882  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>