31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0168 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  34.96 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  33.63 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  34.96 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  34.51 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  32.74 
 
 		 216 aa  142  3e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  34.96 
 
 		 216 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  32.74 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  35.51 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  33.77 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  34.53 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  31.42 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  33.8 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  32.74 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  33.48 
 
 		 216 aa  132  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  29.65 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  34.33 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  34.07 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  31.47 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  31.11 
 
 		 216 aa  125  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  29.52 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  32.31 
 
 		 216 aa  122  7e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  30.83 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  29.78 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  26.99 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  28.04 
 
 		 220 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  31.43 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  25.52 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  26.99 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  21.68 
 
 		 218 aa  57  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  30.83 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>