31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3770 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  63.59 
 
 		 218 aa  295  4e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  64.19 
 
 		 216 aa  281  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  61.11 
 
 		 216 aa  279  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  60.65 
 
 		 216 aa  277  7e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  60.65 
 
 		 216 aa  277  7e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  60.19 
 
 		 216 aa  274  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  58.8 
 
 		 216 aa  274  8e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  58.33 
 
 		 216 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  61.93 
 
 		 218 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  57.34 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  60.19 
 
 		 216 aa  257  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  61.57 
 
 		 216 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  56.94 
 
 		 216 aa  251  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  50 
 
 		 218 aa  231  9e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  46.98 
 
 		 217 aa  204  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  33.63 
 
 		 230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  34.72 
 
 		 216 aa  132  5e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  32.72 
 
 		 216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  31.65 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  27.59 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  29.57 
 
 		 226 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  28.23 
 
 		 212 aa  98.2  8e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  25.96 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  26.5 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  30.61 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  28.51 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  27.57 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  29.08 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  26.85 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  20.74 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>