32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0331 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 219 aa  431  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  33.8 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  29.6 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  33.89 
 
 		 220 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  28.05 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  27.65 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  26.73 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  26.73 
 
 		 216 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  31.05 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  28.9 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  29.33 
 
 		 216 aa  94.7  9e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  28.76 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  25.96 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  25.94 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  25.49 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  27.88 
 
 		 218 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  23.5 
 
 		 216 aa  89  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  23.5 
 
 		 216 aa  88.2  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  25.59 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  25.6 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  24.88 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  30.41 
 
 		 218 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  29.53 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  24.5 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  24.88 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  23.5 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  24.32 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  23.58 
 
 		 215 aa  72.8  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  29.38 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  24.41 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  25.96 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3334  hypothetical protein  25.91 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>