31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002366 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 216 aa  436  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  86.57 
 
 		 216 aa  384  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  47.69 
 
 		 216 aa  218  5e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  44.44 
 
 		 212 aa  185  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  31.44 
 
 		 230 aa  128  5.0000000000000004e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  31.65 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  29.78 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  31.16 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  34.91 
 
 		 216 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  34.91 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  35.55 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  34.23 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  34.23 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  33.78 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  33.33 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  30.09 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  33.97 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  32.41 
 
 		 218 aa  105  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  28.97 
 
 		 226 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  34.1 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  34.11 
 
 		 216 aa  95.1  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  28.85 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  25.49 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  35.14 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  26.92 
 
 		 217 aa  85.1  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  25.59 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  26.89 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  26.82 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  29.68 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  25.48 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  25.23 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>