32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3753 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3753  MSHA biogenesis protein MshJ  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0506  MSHA biogenesis protein MshJ  64.35 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0503  MSHA biogenesis protein MshJ  63.89 
 
 		 216 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3837  MSHA biogenesis protein MshJ  63.89 
 
 		 216 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0482  MSHA biogenesis protein MshJ  63.89 
 
 		 216 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3665  MSHA biogenesis protein MshJ  59.72 
 
 		 216 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3488  MSHA biogenesis protein MshJ  59.72 
 
 		 216 aa  278  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3770  MSHA biogenesis protein MshJ  57.34 
 
 		 218 aa  268  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0464  MSHA biogenesis protein MshJ  60.65 
 
 		 216 aa  268  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0558  MSHA biogenesis protein MshJ  61.11 
 
 		 216 aa  267  7e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3349  MSHA biogenesis protein MshJ  58.72 
 
 		 218 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4114  MSHA biogenesis protein MshJ  62.5 
 
 		 216 aa  263  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0387  MSHA biogenesis protein MshJ  59.63 
 
 		 218 aa  248  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0542  MSHA biogenesis protein MshJ  57.21 
 
 		 216 aa  246  2e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4419  MSHA biogenesis protein MshJ  52.53 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0452  MSHA biogenesis protein MshJ  50.48 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0168  MSHA biogenesis protein MshJ  34.33 
 
 		 230 aa  129  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2818  MSHA biogenesis protein MshJ  34.72 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002366  MSHA biogenesis protein MshJ  30.09 
 
 		 216 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03700  hypothetical protein  29.77 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0891  hypothetical protein  28.32 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.836159 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0467  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin D (MSHJ)  31.1 
 
 		 212 aa  97.8  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.242549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1133  hypothetical protein  27.66 
 
 		 239 aa  95.1  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0346936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0331  MSHA biogenesis protein MshJ  25.94 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4578  hypothetical protein  28.21 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00249  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshJ (pilus type IV)  28.9 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0383  MshA biogenesis protein, MshJ-like  29.53 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3276  MSHA biogenesis protein MshJ  27.53 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3094  MshA biogenesis protein, MshJ-like protein  30.91 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0751  hypothetical protein  23.58 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0111787  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0762  hypothetical protein  22.07 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00540771  normal  0.362126 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3334  hypothetical protein  24.31 
 
 		 217 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.480037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>