More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1443 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1443  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  100 
 
 		 289 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1256  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  97.92 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2052  2,3-dimethylmalate lyase  79.58 
 
 		 289 aa  484  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1389  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase, putative  77.51 
 
 		 291 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4334  PEP phosphonomutase and related enzymes-like protein  77.51 
 
 		 289 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.336989 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4424  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  77.16 
 
 		 289 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.422397  normal  0.503119 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1029  carboxyphosphonoenolpyruvate phosphonomutase  75.78 
 
 		 289 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0689  2,3-dimethylmalate lyase  75.43 
 
 		 290 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64440  hypothetical protein  74.05 
 
 		 287 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.63123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5594  hypothetical protein  73.7 
 
 		 344 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0251  2,3-dimethylmalate lyase  71.28 
 
 		 287 aa  422  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2926  hypothetical protein  69.55 
 
 		 287 aa  414  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.139867  normal  0.838283 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20130  hypothetical protein  68.17 
 
 		 287 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5152  hypothetical protein  54.01 
 
 		 302 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2772  2,3-dimethylmalate lyase  53.15 
 
 		 290 aa  311  1e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3351  hypothetical protein  50.82 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.329666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3584  putative carboxy-phosphonoenolpyruvate mutase  44.95 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3092  hypothetical protein  44.83 
 
 		 289 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0274905 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4901  2,3-dimethylmalate lyase  49.19 
 
 		 288 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2368  hypothetical protein  44.1 
 
 		 289 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.784144 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2147  2,3-dimethylmalate lyase  39.22 
 
 		 299 aa  185  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.947879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1614  2,3-dimethylmalate lyase  34.23 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.863287  normal  0.36405 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4474  2,3-dimethylmalate lyase  34.43 
 
 		 294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7954  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.84 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2154  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  31.4 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.908949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0864  2,3-dimethylmalate lyase  31.91 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000979692  hitchhiker  0.000000949403 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0256  putative methylisocitrate lyase  31.16 
 
 		 288 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.764901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2499  2-methylisocitrate lyase  31.09 
 
 		 292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.741837  normal  0.047618 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2822  2-methylisocitrate lyase  31.69 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2111  2-methylisocitrate lyase  31.09 
 
 		 292 aa  127  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.12913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1933  isocitrate lyase family protein  36.56 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5405  putative carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  34.18 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00321329  normal  0.260192 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1203  2,3-dimethylmalate lyase  34.18 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00337991  normal  0.996052 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1869  2-methylisocitrate lyase  31.51 
 
 		 292 aa  125  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.127999 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03370  2-methylisocitrate lyase  30.25 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4291  2,3-dimethylmalate lyase  36.2 
 
 		 295 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.268229 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3579  PEP phosphonomutase  31.62 
 
 		 286 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00948814  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2322  2-methylisocitrate lyase  29.83 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0624  2,3-dimethylmalate lyase  32.62 
 
 		 306 aa  124  3e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2934  putative methylisocitrate lyase  30.53 
 
 		 288 aa  123  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0783  methylisocitrate lyase  30.9 
 
 		 312 aa  122  5e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.649003 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4025  isocitrate lyase family protein  34.87 
 
 		 284 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0661  2,3-dimethylmalate lyase  32.13 
 
 		 310 aa  122  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.428755 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1657  2,3-dimethylmalate lyase  35.56 
 
 		 306 aa  122  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  0.68628 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1054  isocitrate lyase family protein  36.99 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138813  normal  0.876203 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1820  2-methylisocitrate lyase  29.41 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1664  2-methylisocitrate lyase  30.52 
 
 		 292 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4268  2,3-dimethylmalate lyase  30.5 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.485286  normal  0.877406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4144  isocitrate lyase family protein  34.45 
 
 		 284 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1419  2-methylisocitrate lyase  28.47 
 
 		 292 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4051  isocitrate lyase family protein  34.45 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0108  methylisocitrate lyase  31.36 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0279515  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1197  2-methylisocitrate lyase  25.72 
 
 		 297 aa  119  3.9999999999999996e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1857  2-methylisocitrate lyase  29.41 
 
 		 292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3949  isocitrate lyase family protein  34.45 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5990  2,3-dimethylmalate lyase  34.8 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0792782 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0781  methylisocitrate lyase  32.68 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4841  2,3-dimethylmalate lyase  33.58 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0279  2,3-dimethylmalate lyase  34.65 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.577564  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2479  methylisocitrate lyase  30.07 
 
 		 304 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0974909  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3008  methylisocitrate lyase  30.8 
 
 		 302 aa  116  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.62358 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0101  methylisocitrate lyase  33.07 
 
 		 308 aa  117  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.248963  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2317  methylisocitrate lyase  31.91 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2378  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.8 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.628231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2452  methylisocitrate lyase  30.8 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.344607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2127  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.8 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2113  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.8 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2369  methylisocitrate lyase  30.8 
 
 		 302 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2513  2,3-dimethylmalate lyase  33.06 
 
 		 293 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0396  methylisocitrate lyase  34.32 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0696555  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2190  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.8 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2350  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  30.8 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3767  2,3-dimethylmalate lyase  33.6 
 
 		 289 aa  114  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0315  2-methylisocitrate lyase  29.13 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3825  2-methylisocitrate lyase  29.13 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3496  methylisocitrate lyase  33.33 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.146967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0509  carboxyvinyl-carboxyphosphonate phosphorylmutase  33.2 
 
 		 289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2158  methylisocitrate lyase  30.43 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081733  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1632  2,3-dimethylmalate lyase  30.68 
 
 		 286 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.171622 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0806  isocitrate lyase family protein  32.79 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1702  methylisocitrate lyase  33.07 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0394396 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4757  2,3-dimethylmalate lyase  30.08 
 
 		 287 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000491467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0071  2-methylisocitrate lyase  29.24 
 
 		 296 aa  112  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3629  2-methylisocitrate lyase  28.74 
 
 		 292 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2605  2-methylisocitrate lyase  28.68 
 
 		 293 aa  112  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.221019  hitchhiker  0.000512853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0345  2-methylisocitrate lyase  28.35 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1029  2,3-dimethylmalate lyase  33.33 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1072  2-methylisocitrate lyase  30.77 
 
 		 301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.765825  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2082  2,3-dimethylmalate lyase  30.28 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.218009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4140  2-methylisocitrate lyase  30.04 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3644  2-methylisocitrate lyase  30.04 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1666  2-methylisocitrate lyase  27.94 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1092  carboxyvinyl-carboxyphosphonatephosphorylmutase  31.5 
 
 		 293 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.301564  normal  0.346372 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3945  2-methylisocitrate lyase  29.61 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4021  2-methylisocitrate lyase  29.61 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1311  2-methylisocitrate lyase  24.28 
 
 		 296 aa  109  5e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0110415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4047  2-methylisocitrate lyase  29.61 
 
 		 292 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3294  2-methylisocitrate lyase  27.52 
 
 		 294 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.203078 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1110  2-methylisocitrate lyase  24.64 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.452189 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1130  2,3-dimethylmalate lyase  34.48 
 
 		 287 aa  108  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>