More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0968 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1788  chaperonin GroEL  81.58 
 
 
542 aa  894    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3340  chaperonin GroEL  60.75 
 
 
544 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0236038  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2334  chaperonin GroEL  65.22 
 
 
553 aa  702    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.623748  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2854  chaperonin GroEL  80.85 
 
 
541 aa  877    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2849  chaperonin GroEL  61.81 
 
 
556 aa  665    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0293  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1217  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
555 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0253  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  639    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000348561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0239  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  640    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000814952  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0240  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000179769  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3242  chaperonin GroEL  80.85 
 
 
541 aa  877    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.695077 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0968  chaperonin GroEL  100 
 
 
543 aa  1083    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59674  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2873  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
542 aa  656    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00235901  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0144  chaperonin GroEL  70.46 
 
 
545 aa  790    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3626  chaperonin GroEL  82.17 
 
 
544 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0876914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3766  chaperonin GroEL  63.18 
 
 
560 aa  673    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0731687  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02010  chaperonin GroEL  63.16 
 
 
547 aa  664    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000193134  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0506  chaperonin GroEL  92.1 
 
 
544 aa  987    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.982033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2137  chaperonin GroEL  61.16 
 
 
539 aa  639    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.817524  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2169  chaperonin GroEL  91.18 
 
 
544 aa  981    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.824864  normal  0.120928 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0029  chaperonin GroEL  59.92 
 
 
546 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109643  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0267  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  639    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000111235  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1529  chaperonin GroEL  92.29 
 
 
545 aa  1013    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0685  chaperonin GroEL  61.24 
 
 
555 aa  656    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2313  chaperonin GroEL  82.17 
 
 
544 aa  897    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.618508  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1406  chaperonin GroEL  63.26 
 
 
544 aa  661    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000472194  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0546  chaperonin GroEL  61.28 
 
 
539 aa  649    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760166  normal  0.951326 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2129  chaperonin GroEL  62 
 
 
536 aa  659    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000897626  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0252  chaperonin GroEL  62.31 
 
 
542 aa  644    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000141671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0317  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  640    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000289834  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2884  chaperonin GroEL  83.79 
 
 
543 aa  902    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.754442  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3205  chaperonin GroEL  64.46 
 
 
576 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16261  chaperonin GroEL  92.11 
 
 
545 aa  1010    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2007  chaperonin GroEL  61.19 
 
 
547 aa  635    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2231  chaperonin GroEL  60.22 
 
 
545 aa  638    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0298  chaperonin GroEL  62.24 
 
 
544 aa  641    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00161159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0161  chaperonin GroEL  61.11 
 
 
539 aa  657    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5026  chaperonin GroEL  62.43 
 
 
544 aa  642    Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0231  chaperonin GroEL  60.15 
 
 
539 aa  638    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00131384  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0270  chaperonin GroEL  63.14 
 
 
561 aa  672    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0578222 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4327  chaperonin GroEL  82.17 
 
 
544 aa  889    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.645492  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0204  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
543 aa  634    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0175  chaperonin GroEL  60.66 
 
 
540 aa  640    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0553371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1110  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
538 aa  645    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5137  chaperonin GroEL  84.22 
 
 
545 aa  914    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15551  chaperonin GroEL  94.48 
 
 
543 aa  1017    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0101  chaperonin GroEL  61.03 
 
 
539 aa  635    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4307  chaperonin GroEL  60.11 
 
 
549 aa  639    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000613122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1089  chaperonin GroEL  60.07 
 
 
545 aa  648    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000383154  normal  0.0318123 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0246  chaperonin GroEL  62.05 
 
 
544 aa  642    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00656805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0380  chaperonin GroEL  61.04 
 
 
538 aa  660    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000073104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0957  chaperonin GroEL  61.58 
 
 
538 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16381  chaperonin GroEL  92.29 
 
 
545 aa  1011    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16151  chaperonin GroEL  92.1 
 
 
544 aa  1007    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.48586  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18361  chaperonin GroEL  99.26 
 
 
543 aa  1074    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.393349  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05041  chaperonin GroEL  92.28 
 
 
544 aa  993    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1190  chaperonin GroEL  60.65 
 
 
555 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2892  chaperonin GroEL  60.64 
 
 
541 aa  635    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1230  chaperonin GroEL  59.38 
 
 
541 aa  633  1e-180  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1408  chaperonin GroEL  59.29 
 
 
550 aa  633  1e-180  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.870477 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4398  chaperonin GroEL  59.01 
 
 
540 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1097  chaperonin GroEL  58.24 
 
 
553 aa  631  1e-180  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000134813  hitchhiker  0.000260243 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0610  chaperonin GroEL  60 
 
 
546 aa  631  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.912876  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1855  hypothetical protein  59.89 
 
 
546 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.590416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3372  chaperonin GroEL  62.12 
 
 
546 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2802  chaperonin GroEL  60.19 
 
 
554 aa  633  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000892075  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2929  chaperonin GroEL  58.87 
 
 
548 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00334026  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21770  chaperonin GroL  60.79 
 
 
543 aa  628  1e-179  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126333  normal  0.154597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3298  chaperonin GroEL  59.48 
 
 
539 aa  629  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.41528  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3854  chaperonin GroEL  61.48 
 
 
545 aa  629  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0924  chaperonin GroEL  60.49 
 
 
542 aa  626  1e-178  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00446655  unclonable  9.722580000000001e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0450  chaperonin GroEL  59.85 
 
 
548 aa  626  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000441199  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0598  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
541 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0607  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
541 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.586034  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8910  chaperonin GroEL  60.22 
 
 
541 aa  625  1e-178  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0233  chaperonin GroEL  59.47 
 
 
547 aa  627  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0667  chaperonin GroEL  60.57 
 
 
544 aa  626  1e-178  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000291491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0249  chaperonin GroEL  59.62 
 
 
547 aa  627  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000471437  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1918  chaperonin GroEL  57.64 
 
 
540 aa  625  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0620  chaperonin GroEL  59.89 
 
 
541 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.474961  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0228  chaperonin GroEL  58.67 
 
 
541 aa  622  1e-177  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0141  chaperonin GroEL  59.71 
 
 
541 aa  622  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1828  chaperonin GroEL  58.38 
 
 
542 aa  621  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.320328  normal  0.0519558 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0121  chaperonin GroEL  58.9 
 
 
543 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222262  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0764  chaperonin GroEL  59.34 
 
 
541 aa  622  1e-177  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.761225  normal  0.671029 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0513  chaperonin GroEL  59.26 
 
 
541 aa  620  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6115  chaperonin GroEL  59.56 
 
 
542 aa  619  1e-176  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.972014  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0755  chaperonin GroEL  60.38 
 
 
546 aa  618  1e-176  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10445  chaperonin GroEL  59.96 
 
 
540 aa  620  1e-176  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00698847  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0442  chaperonin GroEL  59.27 
 
 
540 aa  619  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3353  chaperonin GroEL  60.31 
 
 
542 aa  618  1e-176  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0804  chaperonin GroEL  58.93 
 
 
540 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2493  chaperonin GroEL  59.36 
 
 
540 aa  618  1e-176  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0308  chaperonin GroEL  60 
 
 
544 aa  620  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0755477  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0386  chaperonin GroEL  58.41 
 
 
544 aa  618  1e-175  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0411403  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0415  chaperonin GroEL  58.92 
 
 
538 aa  617  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808798  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0439  chaperonin GroEL  58.35 
 
 
546 aa  616  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000414877  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3376  chaperonin GroEL  58.79 
 
 
549 aa  615  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0621223 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2066  chaperonin GroEL  56.3 
 
 
538 aa  617  1e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.172962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0430  chaperonin GroEL  58.92 
 
 
538 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000678995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>