More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27735 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_27735  predicted protein  100 
 
 		 538 aa  1113    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.326245  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70121  GMP synthase  58.96 
 
 		 528 aa  607  9.999999999999999e-173  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0970266  normal  0.0696406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1628  GMP synthase  55.98 
 
 		 511 aa  585  1e-166  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.948363  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05566  GMP synthase [glutamine-hydrolyzing] (EC 6.3.5.2)(Glutamine amidotransferase)(GMP synthetase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B1L4]  55.13 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.152629  normal  0.706749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1946  GMP synthase  56.3 
 
 		 513 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1525  GMP synthase  55.3 
 
 		 518 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0589  GMP synthase  56.13 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2348  GMP synthase  55.11 
 
 		 518 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598137  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02180  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  55.97 
 
 		 544 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1521  GMP synthase  55.3 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1616  GMP synthase  55.11 
 
 		 518 aa  562  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2315  GMP synthase, large subunit  52.57 
 
 		 514 aa  560  1e-158  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2644  GMP synthase  55.53 
 
 		 513 aa  561  1e-158  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1806  GMP synthase  54.14 
 
 		 511 aa  560  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.150874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2123  GMP synthase  54.2 
 
 		 518 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.69459  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1901  GMP synthase  53.18 
 
 		 517 aa  557  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.783209  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1470  GMP synthase  55.09 
 
 		 516 aa  557  1e-157  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000562648  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3123  GMP synthase  53.56 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0241  GMP synthase  55.51 
 
 		 513 aa  558  1e-157  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1793  GMP synthase  53.35 
 
 		 515 aa  558  1e-157  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0765  GMP synthase  54.14 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0677  GMP synthase, large subunit  54.02 
 
 		 522 aa  556  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0782  GMP synthase  53.76 
 
 		 516 aa  555  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0315  GMP synthase  54.84 
 
 		 518 aa  552  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.185414 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2292  GMP synthase  55.94 
 
 		 520 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.817555  normal  0.348975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0989  GMP synthase  53.74 
 
 		 515 aa  552  1e-156  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000791006  hitchhiker  0.000562363 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0342  GMP synthase  54.67 
 
 		 514 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1218  GMP synthase  54.98 
 
 		 520 aa  548  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0300  GMP synthase  54.96 
 
 		 513 aa  550  1e-155  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.176102  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2496  GMP synthase  52.22 
 
 		 515 aa  546  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.1964  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1423  GMP synthase, large subunit  51.63 
 
 		 512 aa  545  1e-154  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1667  GMP synthase  53.95 
 
 		 513 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3125  GMP synthase  53.37 
 
 		 515 aa  542  1e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0979227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2010  GMP synthase  53.32 
 
 		 520 aa  542  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1950  GMP synthase  53.18 
 
 		 515 aa  544  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0718  GMP synthase  52.6 
 
 		 513 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1778  GMP synthase  53.08 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0328  GMP synthase  53.45 
 
 		 520 aa  538  9.999999999999999e-153  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1454  GMP synthase, large subunit  53.08 
 
 		 514 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0229211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0327  GMP synthase  53.26 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1739  GMP synthase  54.34 
 
 		 512 aa  538  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0220  GMP synthase  50.1 
 
 		 522 aa  540  9.999999999999999e-153  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4571  GMP synthase  53.26 
 
 		 520 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.855441  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4308  GMP synthase  53.26 
 
 		 520 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25397  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0361  GMP synthase  53.45 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.190367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1557  GMP synthase, large subunit  51.63 
 
 		 512 aa  537  1e-151  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000239894  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1751  GMP synthase  53.41 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.485294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2132  GMP synthase  54.02 
 
 		 512 aa  535  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0422  GMP synthase  53.46 
 
 		 516 aa  536  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3058  GMP synthase  52.87 
 
 		 523 aa  537  1e-151  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0966  GMP synthase  52.02 
 
 		 509 aa  538  1e-151  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.527198  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0836  GMP synthase  53.26 
 
 		 533 aa  535  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.008715  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2194  GMP synthase  54.02 
 
 		 520 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0163  GMP synthase, large subunit  51.62 
 
 		 525 aa  533  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3517  GMP synthase  53.24 
 
 		 520 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3614  GMP synthase  54.3 
 
 		 534 aa  535  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2269  GMP synthase  52.96 
 
 		 556 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541083  normal  0.141727 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0907  GMP synthase  50.93 
 
 		 575 aa  534  1e-150  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2216  GMP synthase  52.58 
 
 		 528 aa  532  1e-150  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1184  GMP synthase  53.44 
 
 		 519 aa  532  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.550912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2498  GMP synthase  52.58 
 
 		 565 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.78922  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0755  GMP synthase  52.49 
 
 		 560 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.326962  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2143  GMP synthase  53.15 
 
 		 535 aa  529  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.188131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1139  GMP synthase  52.44 
 
 		 526 aa  530  1e-149  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.137379 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2542  GMP synthase  53.05 
 
 		 540 aa  531  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0495  GMP synthase  53.64 
 
 		 519 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3458  GMP synthase, large subunit  53.24 
 
 		 525 aa  529  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.160895 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0595  GMP synthase, large subunit  53.47 
 
 		 511 aa  527  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0294  GMP synthase  51.32 
 
 		 537 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.223502  normal  0.0574353 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0993  GMP synthase  52.12 
 
 		 508 aa  526  1e-148  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0724  GMP synthase  51.24 
 
 		 510 aa  526  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1171  GMP synthase  53.15 
 
 		 526 aa  526  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0934  GMP synthase  52.02 
 
 		 509 aa  526  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0445641  normal  0.514334 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3014  GMP synthase  51.7 
 
 		 533 aa  528  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0686711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_740  GMP synthase (glutamine-hydrolysing)  52.49 
 
 		 560 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1727  GMP synthase  51.69 
 
 		 525 aa  526  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.865891  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B17  GMP synthase  50.29 
 
 		 511 aa  525  1e-147  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3478  GMP synthase  52.41 
 
 		 514 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1635  GMP synthase  50.97 
 
 		 513 aa  523  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1199  GMP synthase  50.95 
 
 		 522 aa  523  1e-147  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.651967  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0192  GMP synthase, large subunit  50.38 
 
 		 512 aa  523  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1294  GMP synthase  53.54 
 
 		 518 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141337  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2105  GMP synthase  52.12 
 
 		 516 aa  521  1e-146  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0748059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3189  GMP synthase  53.15 
 
 		 540 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2862  GMP synthase, large subunit  52.22 
 
 		 510 aa  519  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.339374  normal  0.56979 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0231  GMP synthase  49.53 
 
 		 517 aa  521  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.233055  hitchhiker  2.8816700000000002e-18 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6854  GMP synthase  52.49 
 
 		 512 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.727816  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4241  GMP synthase  50.57 
 
 		 525 aa  515  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0964  GMP synthase  52.85 
 
 		 518 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2697  GMP synthase  52.02 
 
 		 509 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.421938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2589  GMP synthase  51.63 
 
 		 528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004340  GMP synthase (glutamine-hydrolyzing)  49.71 
 
 		 517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0451  GMP synthase  51.7 
 
 		 518 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.678653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0189  GMP synthase  50.38 
 
 		 575 aa  516  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0769  GMP synthase, large subunit  50.96 
 
 		 510 aa  515  1.0000000000000001e-145  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  hitchhiker  0.000357154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3063  GMP synthase  52.2 
 
 		 535 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.83003  normal  0.0562453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1312  GMP synthase  51.21 
 
 		 527 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1264  GMP synthase  52.58 
 
 		 510 aa  516  1.0000000000000001e-145  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3367  GMP synthase  51.37 
 
 		 541 aa  515  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  51.82 
 
 		 518 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>