More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5763 on replicon NC_011738
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011738  PCC7424_5763  ABC transporter related  100 
 
 
632 aa  1290    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2437  ABC transporter related  54.12 
 
 
604 aa  615  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000799452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2086  ABC transporter related  40.82 
 
 
592 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1652  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.86 
 
 
555 aa  171  3e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000177723  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.4 
 
 
586 aa  167  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5496  ABC transporter related  27.66 
 
 
598 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.311446  hitchhiker  0.0036652 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  27.25 
 
 
594 aa  166  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1468  ABC transporter related  27.47 
 
 
627 aa  166  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.308401  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0505  hypothetical protein  26.2 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3873  ABC transporter related  27.77 
 
 
623 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1066  ABC transporter related  26.84 
 
 
571 aa  162  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1564  ABC transporter related  26.75 
 
 
577 aa  162  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0757  ABC transporter related  28.12 
 
 
586 aa  162  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000135449  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2881  ABC transporter related protein  25.1 
 
 
608 aa  160  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000328864  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  27.33 
 
 
573 aa  160  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  27.12 
 
 
589 aa  160  7e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  27.41 
 
 
592 aa  160  8e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2255  ABC transporter related  27.89 
 
 
580 aa  159  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.870645  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1515  ABC transporter related  26.56 
 
 
577 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  27.13 
 
 
582 aa  158  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2333  ABC transporter-related protein  24.88 
 
 
583 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000218217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0922  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.87 
 
 
597 aa  157  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000416921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  26.16 
 
 
600 aa  157  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  28.81 
 
 
612 aa  156  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.85 
 
 
601 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0354  ABC transporter related  28.81 
 
 
612 aa  155  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  26.19 
 
 
586 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06023  ABC efflux transporter permease/ATP-binding protein  25.4 
 
 
586 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0117  ABC transporter related  28.83 
 
 
582 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0033  ABC transporter related protein  28.7 
 
 
569 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1367  ABC transporter related  26.04 
 
 
610 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.186709  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2816  ABC transporter ATPase  25.19 
 
 
588 aa  154  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.372787  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1357  ABC transporter related  29.2 
 
 
1218 aa  154  7e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.572904 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  26.97 
 
 
586 aa  153  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0751  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  27.18 
 
 
586 aa  153  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.27 
 
 
586 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  25.99 
 
 
593 aa  152  2e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  25.44 
 
 
548 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.97 
 
 
586 aa  152  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1595  ABC transporter related  26.83 
 
 
607 aa  151  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00338699  normal  0.481245 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  24.87 
 
 
541 aa  151  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  25.75 
 
 
586 aa  151  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  27.62 
 
 
578 aa  151  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1760  ABC transporter ATP-binding protein  25.79 
 
 
610 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0629  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  25.25 
 
 
587 aa  150  5e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3954  ABC transporter related  25.79 
 
 
610 aa  151  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00633219 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  27.61 
 
 
584 aa  150  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.76 
 
 
586 aa  150  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1351  ABC transporter related  25.25 
 
 
610 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.283519  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1245  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.49 
 
 
587 aa  150  6e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1444  ABC transporter-like protein  27.92 
 
 
613 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0895961  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  28.82 
 
 
1018 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1157  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  27.48 
 
 
638 aa  150  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0429798  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  27.66 
 
 
583 aa  150  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.54 
 
 
586 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3967  ABC transporter related  26.52 
 
 
584 aa  150  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2301  ABC transporter-like protein protein  27.78 
 
 
583 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1770  ABC transporter related  25 
 
 
610 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.686344  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  22.87 
 
 
600 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.76 
 
 
625 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  27.27 
 
 
578 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  26.4 
 
 
611 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  26.65 
 
 
603 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  25.49 
 
 
568 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4659  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.21 
 
 
596 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.265445  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  25.05 
 
 
548 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0894  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  24.86 
 
 
580 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0612543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  26.89 
 
 
586 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 
586 aa  148  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0824  ABC transporter, ATP-binding protein/permease MsbA, putative  24.86 
 
 
580 aa  148  3e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.370431  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.89 
 
 
548 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2216  ABC transporter related  27.63 
 
 
651 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.298218  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  25.42 
 
 
589 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5718  ABC transporter related  23.7 
 
 
589 aa  147  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0744  ABC transporter related protein  35.5 
 
 
1212 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1043  ABC transporter related protein  28.1 
 
 
598 aa  147  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80003  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1890  ABC transporter related  26.44 
 
 
607 aa  147  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53150  ATP-binding/permease fusion ABC transporter  24.6 
 
 
596 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  24.43 
 
 
585 aa  146  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  25.53 
 
 
604 aa  146  9e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  28.07 
 
 
572 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0759  ABC transporter related  33.82 
 
 
600 aa  146  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.165063  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2965  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  27.03 
 
 
596 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0478  ABC transporter ATP-binding protein  27.7 
 
 
592 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2917  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.93 
 
 
576 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12894 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0256  multidrug ABC transporter  28.08 
 
 
583 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.607826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  26.58 
 
 
554 aa  145  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2049  ABC transporter, ATP-binding/permease  25.46 
 
 
585 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  27.45 
 
 
583 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3656  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  24.7 
 
 
608 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0881594  normal  0.719468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  25.83 
 
 
579 aa  145  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  26.61 
 
 
606 aa  145  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  25.61 
 
 
566 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  28.17 
 
 
546 aa  145  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1209  ABC transporter related  29.19 
 
 
584 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4018  cyclic nucleotide-binding protein  28.74 
 
 
574 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1866  heavy metal ABC transporter (HMT) family permease/ATP-binding protein  27.59 
 
 
631 aa  144  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.024089 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  25.53 
 
 
547 aa  144  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3037  ABC transporter related  26.79 
 
 
596 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0583  ABC transporter related  27.2 
 
 
583 aa  144  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>