More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3353 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
527 aa  1031    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.416651  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0815  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
538 aa  280  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.3 
 
 
547 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.46 
 
 
541 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.41 
 
 
671 aa  263  4.999999999999999e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  65.52 
 
 
561 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056342  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.92 
 
 
522 aa  237  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.54 
 
 
699 aa  232  1e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0659  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.38 
 
 
798 aa  229  8e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  51.89 
 
 
569 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.103849  normal  0.0253995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1505  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.06 
 
 
791 aa  224  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  50 
 
 
740 aa  221  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.08 
 
 
675 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.84238 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.3 
 
 
718 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.2 
 
 
600 aa  216  5.9999999999999996e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000337227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.1 
 
 
521 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.67 
 
 
780 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  48.43 
 
 
740 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1372  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  43.38 
 
 
706 aa  208  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 
832 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  52.24 
 
 
779 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1355  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  53.81 
 
 
744 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  50.2 
 
 
695 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  51.36 
 
 
676 aa  203  8e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.61 
 
 
592 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
583 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2364  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  50.86 
 
 
702 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0925  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.28 
 
 
552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 
556 aa  201  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.32 
 
 
908 aa  201  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00046  chemotaxis protein  46.61 
 
 
753 aa  200  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.3 
 
 
589 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2313  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 
567 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.87 
 
 
602 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.91 
 
 
598 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.62 
 
 
623 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.21 
 
 
559 aa  196  6e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 
585 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.75 
 
 
511 aa  196  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.51282  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.38 
 
 
535 aa  196  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  43.24 
 
 
752 aa  196  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
905 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2483  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.19 
 
 
905 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.611307  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.62 
 
 
578 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496762  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1991  chemotaxis sensory transducer  40.36 
 
 
661 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
580 aa  194  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1858  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.51 
 
 
552 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.332391 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.39 
 
 
759 aa  193  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  48.96 
 
 
775 aa  193  8e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1299  methyl-accepting protein IV  47.41 
 
 
533 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139959 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.66 
 
 
542 aa  191  2e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1514  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.06 
 
 
562 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957025  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.17 
 
 
537 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.201713  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.1 
 
 
527 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.823637 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.01 
 
 
586 aa  190  4e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3497  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 
860 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.19961  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1415  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.24 
 
 
546 aa  190  7e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.03 
 
 
544 aa  189  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155197  normal  0.170651 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0151  methyl-accepting chemotaxis protein  40.54 
 
 
678 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  46.61 
 
 
705 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.91 
 
 
579 aa  189  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2178  methyl-accepting protein IV  46.98 
 
 
533 aa  189  1e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.56 
 
 
793 aa  188  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1768  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.83 
 
 
516 aa  189  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
580 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.72 
 
 
575 aa  188  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2623  methyl-accepting protein IV  46.98 
 
 
533 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000448067 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  44.83 
 
 
533 aa  187  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
616 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.69 
 
 
519 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
659 aa  187  3e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0129  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.98 
 
 
511 aa  187  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.469561  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.52 
 
 
544 aa  187  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.643433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1408  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 
513 aa  187  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0311205 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4186  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.32 
 
 
577 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  44.76 
 
 
797 aa  187  5e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5852  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.82 
 
 
618 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.217953  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.55 
 
 
533 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0930328  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  45.42 
 
 
580 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1435  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.631191  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3066  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
662 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0438  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
512 aa  186  6e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212381  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1747  methyl-accepting protein IV  46.55 
 
 
533 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0502  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0157  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.293853  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2862  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  187  6e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0520  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
546 aa  187  6e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.640738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.48 
 
 
662 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.23 
 
 
566 aa  186  7e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
677 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.73 
 
 
536 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.000000611014  hitchhiker  0.00000521325 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6278  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.97 
 
 
512 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.236466  normal  0.246568 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3184  methyl-accepting chemotaxis protein  46.15 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.89 
 
 
585 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.38945  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  43.34 
 
 
559 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>