More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0614 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 541 aa  1075    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  91.41 
 
 		 547 aa  939    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.77 
 
 		 561 aa  293  7e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.056342  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0815  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  55.7 
 
 		 538 aa  267  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.260319  normal  0.290459 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3353  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.416651  normal  0.952681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.86 
 
 		 671 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 		 522 aa  256  6e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.76 
 
 		 521 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  52.7 
 
 		 569 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.103849  normal  0.0253995 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1505  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.65 
 
 		 791 aa  218  2e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1336  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  49.06 
 
 		 740 aa  217  5e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000730785  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.58 
 
 		 699 aa  212  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2373  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.52 
 
 		 718 aa  207  6e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2663  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.64 
 
 		 520 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0198398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.48 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0727  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.56 
 
 		 559 aa  204  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0659  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.71 
 
 		 798 aa  204  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4354  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.69 
 
 		 555 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6699  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.18 
 
 		 575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.198234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2364  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  54.9 
 
 		 702 aa  201  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1622  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.97 
 
 		 572 aa  200  6e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.415216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1355  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  55.39 
 
 		 744 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.3 
 
 		 832 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  55.39 
 
 		 740 aa  196  8.000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1956  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 		 598 aa  196  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4355  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 		 540 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.31766  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0276  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.42 
 
 		 657 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461968  normal  0.560518 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00041  chemotaxis protein  46.67 
 
 		 752 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.292066  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.76 
 
 		 677 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2967  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  45.55 
 
 		 695 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000011738  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1619  chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 		 559 aa  194  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.940607  normal  0.203143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1498  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.05 
 
 		 602 aa  194  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0750  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.318431  normal  0.0335504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4062  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 653 aa  194  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 653 aa  194  5e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0729  PAS  50.44 
 
 		 945 aa  193  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0635035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0728  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.72 
 
 		 792 aa  193  6e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.066629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0298  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.14 
 
 		 600 aa  193  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000337227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.64 
 
 		 740 aa  192  9e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1372  putative methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  45.45 
 
 		 706 aa  192  1e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1768  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.64 
 
 		 516 aa  192  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1542  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.11 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.350049  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0428  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 597 aa  192  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00039  chemotaxis protein  43.58 
 
 		 775 aa  192  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.371493  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 		 555 aa  191  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.27 
 
 		 615 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.371991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.69 
 
 		 586 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.167359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0695  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.6 
 
 		 561 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.305861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0660  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 		 675 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.84238 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.71 
 
 		 584 aa  191  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4001  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.47 
 
 		 585 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0946714  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0395  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.31 
 
 		 556 aa  191  4e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.72 
 
 		 517 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000944533  normal  0.933191 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3516  methyl-accepting chemotaxis protein  43.97 
 
 		 557 aa  191  4e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.698348 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1130  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.306094  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1044  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.57 
 
 		 584 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2002  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 		 569 aa  190  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1571  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.295886  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0232  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  190  5e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  49.57 
 
 		 584 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.480757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0972  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.37 
 
 		 535 aa  190  5.999999999999999e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4703  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.93 
 
 		 659 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2139  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 616 aa  190  7e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.942679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4072  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 		 540 aa  190  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2225  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.33 
 
 		 583 aa  190  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.220406  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 		 557 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1642  methyl-accepting chemotaxis protein  43.97 
 
 		 557 aa  189  8e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3123  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 555 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000142041  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3412  putative methyl-accepting chemotaxis I (serine chemoreceptor) transmembrane protein  47.67 
 
 		 515 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.934147 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0933  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50 
 
 		 780 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.156704 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2374  methyl-accepting chemotaxis protein  46.93 
 
 		 586 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.205822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2163  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.09 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1983  methyl-accepting chemotaxis protein  47.35 
 
 		 580 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2019  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 		 567 aa  189  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00054  methyl-accepting chemotaxis protein  48.75 
 
 		 797 aa  189  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.276697  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1847  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.85 
 
 		 793 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143361  normal  0.380239 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0409  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.86 
 
 		 585 aa  189  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4292  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.6 
 
 		 535 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2456  methyl-accepting protein IV  46.8 
 
 		 533 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2682  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 		 580 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0687  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.94 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.88 
 
 		 507 aa  189  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.264745  normal  0.414024 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0379  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 542 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.366227  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1620  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 		 559 aa  188  3e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.439493  normal  0.532508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  56.52 
 
 		 676 aa  187  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1374  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.21 
 
 		 908 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4414  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 		 518 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.684904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 		 618 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487659 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00043  chemotaxis protein  50 
 
 		 705 aa  188  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0749  aerotaxis sensor receptor  48.03 
 
 		 669 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4454  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.84 
 
 		 653 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.625525  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0264  methyl-accepting chemotaxis protein  48.03 
 
 		 580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1872  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1169  methyl-accepting chemotaxis protein  46.13 
 
 		 542 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0927  methyl-accepting chemotaxis protein  48.03 
 
 		 623 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.35 
 
 		 578 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.274613  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.11 
 
 		 905 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2685  methyl-accepting chemotaxis protein  48.03 
 
 		 580 aa  187  4e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.394636  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>