More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0572 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0572  ABC transporter related  100 
 
 
227 aa  449  1e-125  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.19 
 
 
237 aa  192  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.32 
 
 
230 aa  192  3e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1211  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.3 
 
 
225 aa  190  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 
236 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.67 
 
 
233 aa  186  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
235 aa  185  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2835  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.33 
 
 
225 aa  184  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.21843  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.92 
 
 
238 aa  184  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0225  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.91 
 
 
235 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  43.24 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  42.79 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.64 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.99 
 
 
239 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2784  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.56 
 
 
235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0359571  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  42.6 
 
 
238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  45.91 
 
 
224 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0174  ABC transporter, ATP-binding protein  42.06 
 
 
235 aa  181  7e-45  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.926259  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.05 
 
 
238 aa  181  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1733  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000305672  normal  0.724903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
234 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.69 
 
 
235 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.56 
 
 
231 aa  180  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  181  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.34 
 
 
226 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 
233 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2517  ABC transporter related protein  42.29 
 
 
255 aa  180  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.25 
 
 
230 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2286  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  180  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00104581  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1813  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.86 
 
 
253 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0357978  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  43.05 
 
 
234 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  45.66 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.02 
 
 
258 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  45.61 
 
 
247 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.79 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 
234 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1760  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.58 
 
 
226 aa  179  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.585377  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.34 
 
 
225 aa  179  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.41 
 
 
234 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  44.8 
 
 
224 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.7 
 
 
247 aa  178  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  43.18 
 
 
230 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2392  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000179176  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2403  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.017802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1955  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00212141  normal  0.0513198 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.09 
 
 
231 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.214498  normal  0.0731118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.61 
 
 
247 aa  177  9e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.67 
 
 
240 aa  177  9e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  43.89 
 
 
241 aa  177  9e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0782  ABC lipoprotein exporter, ATPase subunit, LolD  44.75 
 
 
226 aa  177  1e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000690329  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.79 
 
 
233 aa  177  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  41.78 
 
 
240 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.15 
 
 
236 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  43.89 
 
 
224 aa  177  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 
240 aa  176  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2397  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.3 
 
 
232 aa  177  2e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  39.56 
 
 
249 aa  176  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0612  ABC transporter related  45.1 
 
 
228 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0037706  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.34 
 
 
233 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  40.44 
 
 
228 aa  176  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0788  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  176  3e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00288546  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1920  ABC transporter related  49.51 
 
 
227 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0842487  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2094  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.64 
 
 
225 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0980636  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  42.01 
 
 
235 aa  176  4e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  44.34 
 
 
240 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.45 
 
 
233 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  42.53 
 
 
233 aa  175  6e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1835  ABC transporter-related protein  49.51 
 
 
227 aa  175  6e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0817226  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0230  ABC transporter related  42.11 
 
 
232 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000298 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  44.34 
 
 
240 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.55 
 
 
233 aa  174  9e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  44.34 
 
 
240 aa  174  9e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  43.81 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.390667  normal  0.080358 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0117  ABC transporter  38.07 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  40.64 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  46.36 
 
 
227 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  41.1 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0222  ABC transporter related  42.48 
 
 
232 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  42.27 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0939  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  44.39 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  45.58 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  44.7 
 
 
230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1047  lipoprotein releasing system ATP-binding protein  44.39 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  45.74 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  39.64 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>