81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1330 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 63 aa  124  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 		 70 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.9 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.9 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  45.9 
 
 		 117 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.54 
 
 		 70 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.67 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.71 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.34 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.33 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  47.37 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.28 
 
 		 92 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.26 
 
 		 70 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.61 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.72 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.1 
 
 		 68 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15630  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.28 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0942363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.98 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0842  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.64 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0961  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.37 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.98 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  50 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.26 
 
 		 69 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000980407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.62 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2879  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.48 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000467592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0755  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.29 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3631  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0529446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1286  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.07 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000230469  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0360  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0362  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000590702 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0359  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0329  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.389208  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0352  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3811  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.370537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0354  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.345047  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3614  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.87 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3844  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.67 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.79 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.36 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0239172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0472  RNA polymerase, omega subunit  35.59 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1472  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.86 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.111118  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2326  RNA polymerase, omega subunit  32.26 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000968364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3158  DNA-directed RNA polymerase omega subunit  38.57 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.281429  hitchhiker  0.0000123273 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1851  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.21 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0262472  normal  0.353337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1714  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.99 
 
 		 94 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.770422  hitchhiker  0.00730619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.07 
 
 		 77 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1995  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.3 
 
 		 86 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000371451 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11419  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  36.11 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375558  normal  0.301276 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2400  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.15 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0782645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2237  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  29.03 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12540  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.81 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.492857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3212  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  30.65 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000144072  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0111  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.18 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0644  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.58 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.390309  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1401  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.67 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0891188 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18040  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.8 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0135387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3096  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35.21 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.61729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3126  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.11 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138963  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2446  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.58 
 
 		 131 aa  40.4  0.008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5344  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.71 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.552844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1051  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  30.65 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000307419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2285  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  30.51 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.73 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2346  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.78 
 
 		 99 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.992744  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14810  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  38.24 
 
 		 120 aa  40  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0436889  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.48 
 
 		 91 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 		 65 aa  40  0.01  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.04 
 
 		 123 aa  40  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  31.48 
 
 		 91 aa  40  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>