64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1790 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  100 
 
 		 68 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  73.53 
 
 		 78 aa  106  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  57.97 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.21 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.06 
 
 		 75 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  54.84 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  47.69 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.59 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  49.15 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.65 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.77 
 
 		 65 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.33 
 
 		 72 aa  51.6  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  46.67 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  48.33 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2879  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.25 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000467592  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1213  RNA polymerase, omega subunit  42.59 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.48 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  44.44 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.98 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1724  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.86 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.624474 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2004  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.86 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.159154 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.55 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.36 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0034  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.21 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0777  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.78 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.55 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3844  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  29.63 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.13 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2002  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.22 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.58 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12730  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.5 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0393842  normal  0.0422881 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0635  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.2 
 
 		 88 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.2 
 
 		 88 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1964  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.5 
 
 		 94 aa  42  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.82 
 
 		 117 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  43.4 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.2 
 
 		 88 aa  42  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0961  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.29 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0127007  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0616  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.17 
 
 		 72 aa  42  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1409  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.17 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408548  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4161  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  30.56 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.151933  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0452  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.17 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.133952  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1289  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.17 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0171215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1758  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.82 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238349  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  56.67 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  42.03 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0467  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  34.55 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0571588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  35 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5550  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  31.58 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  32.2 
 
 		 88 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3210  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.89 
 
 		 86 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.150849  normal  0.152706 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>