63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1397 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 104 aa  204  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75.96 
 
 		 104 aa  137  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  60.42 
 
 		 117 aa  100  6e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  62.69 
 
 		 70 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  53.85 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  56.67 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.28 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.28 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.78 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  52.54 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.3 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  46.67 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  38.71 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.68 
 
 		 123 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0252  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45.28 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00381696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.07 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2566  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.51 
 
 		 117 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000389838  unclonable  0.0000000322827 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0049  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  41.67 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1213  RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.492791  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.98 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.91 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.46 
 
 		 65 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.19 
 
 		 66 aa  44.3  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  36.08 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2867  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.72 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.934104  normal  0.0189372 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3590  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3731  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3657  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.284289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1602  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0961  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0127007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2443  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.29 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.604938  normal  0.307716 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0576  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  40.35 
 
 		 86 aa  42.7  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.064194  normal  0.105379 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4972  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  29.03 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0302  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1401  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0891188 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1669  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3711  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0141  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1790  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.4 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0564  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.21 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  46.43 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0718  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.21 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.485199  hitchhiker  0.000000920527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0796  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  33.96 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2577  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  39.62 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611684 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0034  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.48 
 
 		 107 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00154  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.59 
 
 		 90 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0430538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1596  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.68 
 
 		 69 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0138597  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2002  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  37.93 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2400  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.48 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0782645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.38 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0280  RNA polymerase, omega subunit  33.96 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0513  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 117 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>