45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0314 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0314  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  100 
 
 		 104 aa  202  9e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0476821  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1397  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  75.96 
 
 		 104 aa  155  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2157  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  58.33 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1712  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  59.38 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.304184  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0759  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  54.1 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000147732  hitchhiker  0.00000778413 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1175  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  50.77 
 
 		 72 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000347215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09820  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  45 
 
 		 70 aa  50.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1330  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.26 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000123249  normal  0.453103 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1274  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.21 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.356082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1760  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.37 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1230  DNA-directed RNA polymerase, subunit K/omega  36.08 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.763908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3969  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  48.21 
 
 		 70 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0474832  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3693  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.27 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3918  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0905108  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3884  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000729325 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4008  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  43.1 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3629  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2522  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.96468  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3611  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3721  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  49.09 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1314  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  42.59 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.519815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1701  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  44.07 
 
 		 75 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1718  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.83 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2000  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  44.83 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1059  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  47.46 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000066129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5436  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  36.07 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.062566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1949  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  50.85 
 
 		 66 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1036  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  40.32 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1361  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  66.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.465047  normal  0.0594438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2143  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  34.33 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1401  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 118 aa  41.6  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0891188 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2566  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 117 aa  41.6  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00000389838  unclonable  0.0000000322827 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1602  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.175308 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0302  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.445694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1669  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0377  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  33.33 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.648225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2577  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  37.74 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0892  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.38 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2814  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  63.33 
 
 		 87 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.609648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3893  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  41.07 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00496166  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0513  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.85 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2317  DNA-directed RNA polymerase, omega subunit  39.66 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192239  hitchhiker  0.00377511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0970  DNA-directed RNA polymerase subunit omega  35.59 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.528161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>